44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0469 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0469  photosystem I assembly BtpA  100 
 
 		 283 aa  569  1e-161  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3031  photosystem I assembly BtpA  80.36 
 
 		 282 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3089  photosystem I assembly BtpA  80.71 
 
 		 282 aa  463  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0640  photosystem I assembly BtpA  75 
 
 		 309 aa  436  1e-121  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.154831 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0445  photosystem I assembly BtpA  78.41 
 
 		 282 aa  431  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4795  photosystem I assembly BtpA  78.33 
 
 		 290 aa  426  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.89361 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0235  photosystem I assembly BtpA  73.67 
 
 		 284 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.569155  normal  0.455637 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2513  photosystem I assembly BtpA  70.57 
 
 		 294 aa  406  1.0000000000000001e-112  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.145919 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1521  photosystem I assembly BtpA  45.49 
 
 		 278 aa  218  7.999999999999999e-56  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3523  photosystem I assembly BtpA  45.42 
 
 		 281 aa  214  9.999999999999999e-55  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0910027  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2116  photosystem I assembly BtpA  44.16 
 
 		 275 aa  186  3e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3868  photosystem I assembly BtpA  43.61 
 
 		 283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.732531  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1136  photosystem I assembly BtpA  44.54 
 
 		 258 aa  184  1.0000000000000001e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0171957  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2015  photosystem I assembly BtpA  42.42 
 
 		 284 aa  177  1e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0541  photosystem I assembly BtpA  41.73 
 
 		 283 aa  170  3e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.354682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2153  photosystem I assembly BtpA  45.91 
 
 		 265 aa  169  5e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.206239 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7481  hypothetical protein  36.8 
 
 		 280 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.0069483  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3693  BtpA protein  34.46 
 
 		 280 aa  142  6e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6166  photosystem I assembly BtpA  35.21 
 
 		 280 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000474766 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1474  photosystem I assembly BtpA  38.95 
 
 		 279 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2619  photosystem I assembly BtpA  30.19 
 
 		 272 aa  132  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.509941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3780  photosystem I assembly BtpA  29.06 
 
 		 273 aa  129  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.579042  normal  0.711363 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2112  photosystem I assembly BtpA  33.58 
 
 		 267 aa  127  3e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.348808  normal  0.986684 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3428  photosystem I assembly BtpA  32.3 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3314  photosystem I assembly BtpA  28.95 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3749  photosystem I assembly BtpA  27.41 
 
 		 272 aa  122  6e-27  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2468  photosystem I assembly BtpA  28.3 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.492629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0889  photosystem I assembly BtpA  35.22 
 
 		 242 aa  120  3e-26  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0929  photosystem I assembly BtpA  34.65 
 
 		 241 aa  120  3e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.28389  normal  0.101264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2423  photosystem I assembly BtpA  28.3 
 
 		 271 aa  120  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2462  photosystem I assembly BtpA  28.3 
 
 		 271 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1621  photosystem I assembly BtpA  34.78 
 
 		 241 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.123371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3686  photosystem I assembly BtpA  29.32 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04130  hypothetical protein  27.82 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3697  photosystem I assembly BtpA  27.82 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1546  hypothetical protein  28.73 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04168  predicted nucleoside triphosphatase  27.82 
 
 		 268 aa  113  3e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1972  photosystem I assembly BtpA  34.48 
 
 		 242 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1727  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  112  6e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.19381  normal  0.3665 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1732  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1729  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  112  8.000000000000001e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.149256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1793  hypothetical protein  28.36 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.380259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1082  photosystem I assembly BtpA  29.34 
 
 		 262 aa  109  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1266  photosystem I assembly BtpA  28.17 
 
 		 267 aa  92  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>