16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0417 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0417  AAA ATPase  100 
 
 
433 aa  882    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1894  hypothetical protein  24.75 
 
 
440 aa  105  1e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.999283  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1810  hypothetical protein  23.64 
 
 
441 aa  94.7  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1452  hypothetical protein  25.69 
 
 
441 aa  93.6  7e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0150182  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3997  hypothetical protein  23.24 
 
 
441 aa  90.9  4e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.200317  normal  0.946215 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2105  hypothetical protein  25.37 
 
 
434 aa  86.3  9e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.152835 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3770  hypothetical protein  25.75 
 
 
455 aa  85.9  0.000000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00806133 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1557  hypothetical protein  25 
 
 
450 aa  84.3  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.283773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0697  hypothetical protein  24.56 
 
 
468 aa  84.3  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4870  hypothetical protein  24.04 
 
 
451 aa  81.3  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1840  hypothetical protein  23.44 
 
 
443 aa  80.9  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.835777  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2892  hypothetical protein  25 
 
 
443 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000583528 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3924  hypothetical protein  24.75 
 
 
438 aa  76.3  0.0000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.647872  hitchhiker  0.00979003 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0872  hypothetical protein  24.14 
 
 
456 aa  71.6  0.00000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0833922  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2007  hypothetical protein  22.5 
 
 
455 aa  64.7  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3933  hypothetical protein  22.07 
 
 
479 aa  61.6  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.218593  unclonable  0.0000403133 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>