65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_2564 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_2564  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 150 aa  306  6.999999999999999e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0691  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.34 
 
 		 152 aa  53.5  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0246  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0260  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 		 145 aa  51.6  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.696152  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0281  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0310  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0232  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0234  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 147 aa  50.4  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0286  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.67 
 
 		 147 aa  50.8  0.000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2596  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.51 
 
 		 149 aa  49.3  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0178817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.56 
 
 		 147 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3182  acetyltransferase  29.91 
 
 		 142 aa  48.5  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.44 
 
 		 147 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 159 aa  47.8  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0218  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  41.94 
 
 		 150 aa  47.8  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0238  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 147 aa  47.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00071184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  34.43 
 
 		 286 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0185  putative acetyltransferase  30.11 
 
 		 145 aa  46.2  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.227031 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  34.43 
 
 		 286 aa  46.2  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3518  GCN5-related N-acetyltransferase  25.62 
 
 		 145 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2877  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.7 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.199566  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45190  predicted protein  36.71 
 
 		 364 aa  45.8  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2424  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 		 148 aa  45.1  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1160  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.59 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2134  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28 
 
 		 148 aa  44.7  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2478  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.263988  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0193  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 		 147 aa  44.3  0.0006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.453288  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2943  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.32 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000136246  normal  0.0173335 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1048  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  37.7 
 
 		 150 aa  43.9  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.070791  hitchhiker  0.00513124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3667  GCN5-related N-acetyltransferase  23.97 
 
 		 143 aa  43.9  0.0008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.104789  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3493  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.07 
 
 		 153 aa  43.5  0.0009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000220651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2322  GCN5-related N-acetyltransferase  25.86 
 
 		 178 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.45689 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.51 
 
 		 147 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2492  GCN5-related N-acetyltransferase  35.59 
 
 		 178 aa  42.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.314517 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4488  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.98 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.291315  normal  0.765144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.34 
 
 		 150 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.98 
 
 		 151 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.26403  normal  0.0724993 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0822  hypothetical protein  26.15 
 
 		 144 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.045607  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1757  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.59 
 
 		 160 aa  42  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.106645  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0729  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.98 
 
 		 151 aa  42.7  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.873568  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0131  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 		 151 aa  42  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1842  GCN5-related N-acetyltransferase  30.26 
 
 		 381 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.204428  normal  0.0184988 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0800  acetyltransferase  28.69 
 
 		 144 aa  41.6  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.768673  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2174  acetyltransferase  33.78 
 
 		 150 aa  42  0.003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00703282  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0697  acetyltransferase  39.34 
 
 		 151 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29997  predicted protein  25.71 
 
 		 190 aa  41.6  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1138  GCN5-related N-acetyltransferase  32.5 
 
 		 153 aa  41.2  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.428245 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  35.44 
 
 		 176 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16690  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.93 
 
 		 195 aa  41.6  0.004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.499497  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0143  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 		 221 aa  41.6  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0876  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.68 
 
 		 221 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.442348  normal  0.095301 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0371  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.11 
 
 		 167 aa  41.2  0.005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2685  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.78 
 
 		 157 aa  41.2  0.005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0983  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  34.43 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.570176  normal  0.0327101 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0987  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  32.93 
 
 		 150 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.229607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3461  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 		 187 aa  40.8  0.006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0234828 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0895  hypothetical protein  28.57 
 
 		 151 aa  40.4  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1406  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.25 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.964873  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0189  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 		 161 aa  40.8  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1547  acetyltransferase  23.53 
 
 		 166 aa  40.4  0.008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2884  GCN5-related N-acetyltransferase  32.43 
 
 		 335 aa  40  0.01  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00177326  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0328  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.14 
 
 		 189 aa  40  0.01  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3235  GCN5-related N-acetyltransferase  25.56 
 
 		 162 aa  40  0.01  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00983656 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0359  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.48 
 
 		 183 aa  40  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.605225  normal  0.0824399 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3283  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 		 191 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.33549  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>