13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_46260 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_46260  hypothetical protein  100 
 
 		 252 aa  502  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.231061  normal  0.0695784 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3933  hypothetical protein  86.45 
 
 		 264 aa  434  1e-121  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0148216  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3130  DNA polymerase beta subunit  45.53 
 
 		 265 aa  200  1.9999999999999998e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.228068  normal  0.554977 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2709  hypothetical protein  40.16 
 
 		 255 aa  195  6e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2143  hypothetical protein  31.17 
 
 		 258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.812162  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003096  hypothetical protein  28.81 
 
 		 255 aa  112  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000102817  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02750  hypothetical protein  31.71 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0830  hypothetical protein  32.78 
 
 		 264 aa  101  1e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00562618  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0372  hypothetical protein  31.77 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.256043 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2350  nucleotidyltransferase domain protein  19.76 
 
 		 272 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2485  nucleotidyltransferase domain protein  21.71 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2188  hypothetical protein  19.2 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434474  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3581  DNA polymerase beta domain protein region  36.62 
 
 		 287 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>