12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_41910 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_41910  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  251  3e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3557  hypothetical protein  83.78 
 
 		 111 aa  187  5e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2550  hypothetical protein  65.74 
 
 		 108 aa  142  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00171003  hitchhiker  0.00000000117707 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4007  hypothetical protein  56.3 
 
 		 128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000244111  normal  0.940607 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0629  hypothetical protein  36.11 
 
 		 146 aa  63.5  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.856657  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0801  hypothetical protein  32.08 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.443403  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2252  glutaredoxin 2  37.96 
 
 		 132 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.390766 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2220  hypothetical protein  35.78 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.652614  normal  0.464187 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2590  thioredoxin, putative  35.78 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3933  thioredoxin  25.88 
 
 		 107 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5011  thioredoxin  25.88 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0136  thioredoxin  25 
 
 		 107 aa  40.8  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000946631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>