22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06851 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_06851  short chain dehydrogenase  100 
 
 
256 aa  515  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04781  short chain dehydrogenase  61.54 
 
 
257 aa  296  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.864402 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1713  short chain dehydrogenase  59.2 
 
 
249 aa  285  5e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0646  short chain dehydrogenase  57.26 
 
 
245 aa  272  3e-72  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05341  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 
254 aa  242  3.9999999999999997e-63  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.118311 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1810  short chain dehydrogenase  49.15 
 
 
254 aa  239  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0109813  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0478  short chain dehydrogenase  48.02 
 
 
239 aa  220  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05031  short chain dehydrogenase  46.7 
 
 
239 aa  215  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05331  short chain dehydrogenase  47.14 
 
 
239 aa  213  1.9999999999999998e-54  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.647746  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05411  short chain dehydrogenase  47.58 
 
 
238 aa  210  1e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0882215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0598  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  46.55 
 
 
407 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0613  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  46.55 
 
 
407 aa  198  7e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1743  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
409 aa  188  5.999999999999999e-47  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.505987  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3384  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  44.54 
 
 
404 aa  187  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0842787 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0861  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  44.4 
 
 
429 aa  183  2.0000000000000003e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0589823  normal  0.0593314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3742  bifunctional sterol desaturase/short chain dehydrogenase  43.78 
 
 
420 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.843241  normal  0.861127 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4290  fatty acid hydroxylase  40.69 
 
 
412 aa  155  7e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.762452  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3145  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.61 
 
 
535 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.61705 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0461  Alcohol dehydrogenase zinc-binding domain protein  29.08 
 
 
284 aa  48.5  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0561993 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.27 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_12277  hypothetical protein  23.28 
 
 
423 aa  43.9  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.06 
 
 
237 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.140375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>