47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3981 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3981  hypothetical protein  100 
 
 
97 aa  194  5.000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.29169  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5978  conserved hypothetical conserved membrane protein  79.17 
 
 
98 aa  157  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6465  conserved hypothetical conserved membrane protein  80.21 
 
 
98 aa  156  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.982762 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1596  hypothetical protein  80.43 
 
 
93 aa  152  2e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.644548  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0099  hypothetical protein  72.83 
 
 
93 aa  133  8e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  decreased coverage  0.00804392  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2908  hypothetical protein  74.16 
 
 
139 aa  131  1.9999999999999998e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.47453  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1970  small integral membrane protein-like protein  64.52 
 
 
93 aa  117  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1322  hypothetical protein  63.74 
 
 
90 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.457935  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2664  hypothetical protein  63.74 
 
 
90 aa  107  5e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1202  small integral membrane protein-like protein  64.44 
 
 
90 aa  97.1  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.377159  normal  0.6493 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4388  hypothetical protein  60.67 
 
 
93 aa  92.4  2e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1444  hypothetical protein  53.33 
 
 
92 aa  89  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0121261  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4099  hypothetical protein  57.3 
 
 
90 aa  87  8e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0645263  normal  0.5804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2421  hypothetical protein  50 
 
 
92 aa  79  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00903724  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2226  hypothetical protein  44.55 
 
 
109 aa  77  0.00000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.303465  normal  0.0656684 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0388  putative integral membrane protein  45 
 
 
102 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.293835  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0380  putative integral membrane protein  45 
 
 
102 aa  76.6  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000114703  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4890  hypothetical protein  43.12 
 
 
109 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3736  hypothetical protein  49.44 
 
 
90 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0639832  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3672  putative integral membrane protein  48.04 
 
 
102 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00199329  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3332  putative transmembrane protein  55.56 
 
 
93 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.551486 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3050  hypothetical protein  56.94 
 
 
93 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3631  hypothetical protein  48.31 
 
 
91 aa  75.1  0.0000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0608  putative integral membrane protein  55.71 
 
 
102 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2318  putative integral membrane protein  45 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0560205  normal  0.44275 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1029  putative integral membrane protein  45 
 
 
102 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3392  putative integral membrane protein  44.12 
 
 
102 aa  73.6  0.0000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.294707  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1366  hypothetical protein  40.91 
 
 
109 aa  73.2  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0994067  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2985  hypothetical protein  54.17 
 
 
93 aa  72.8  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2090  hypothetical protein  46.59 
 
 
90 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.180478  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0376  hypothetical protein  47.73 
 
 
90 aa  72.4  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.148136  normal  0.453628 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2205  putative integral membrane protein  57.35 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0482  putative integral membrane protein  42.16 
 
 
102 aa  71.6  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00104314  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5371  putative transmembrane protein  46.07 
 
 
93 aa  71.6  0.000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.674172 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1741  hypothetical protein  47.19 
 
 
90 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0472664  normal  0.940326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4212  hypothetical protein  49.33 
 
 
108 aa  70.1  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4064  hypothetical protein  40.57 
 
 
128 aa  69.7  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.42529  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3132  hypothetical protein  46.15 
 
 
132 aa  67  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258717  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6725  putative transmembrane protein  52.94 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3170  hypothetical protein  43.18 
 
 
90 aa  66.2  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.180027  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2046  small integral membrane protein-like protein  47.19 
 
 
90 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0395838  normal  0.868714 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5935  Protein of unknown function DUF2160, transmembrane  52.05 
 
 
90 aa  63.9  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.114344  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1737  small integral membrane protein-like protein  44.32 
 
 
90 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.688593  normal  0.202822 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2230  hypothetical protein  52.94 
 
 
102 aa  57.4  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411171  normal  0.154087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1897  small integral membrane protein-like protein  44.94 
 
 
90 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.124447 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3474  small integral membrane protein-like protein  44.94 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00603331 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2096  Protein of unknown function DUF2160, transmembrane  40.62 
 
 
99 aa  48.1  0.00004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0817847 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>