45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2302 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  100 
 
 
145 aa  293  4e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  59.42 
 
 
174 aa  156  8e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  56.74 
 
 
175 aa  155  2e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  34.06 
 
 
157 aa  82  0.000000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  31.82 
 
 
154 aa  67  0.00000000008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  34.29 
 
 
211 aa  65.9  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  37.89 
 
 
226 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  38.39 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  37.36 
 
 
180 aa  62  0.000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  34.19 
 
 
180 aa  60.8  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  28.67 
 
 
217 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  28 
 
 
241 aa  58.5  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  39.78 
 
 
194 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  37.37 
 
 
221 aa  57.4  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  32.38 
 
 
192 aa  57  0.00000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  32.38 
 
 
192 aa  56.2  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  34 
 
 
217 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  30.83 
 
 
193 aa  55.1  0.0000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  30.48 
 
 
192 aa  54.7  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  30.48 
 
 
192 aa  53.9  0.0000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  29.91 
 
 
273 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4138  phage baseplate assembly protein V  33.33 
 
 
178 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.921384 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  29.7 
 
 
213 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  32.32 
 
 
211 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  30.61 
 
 
213 aa  52  0.000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  26.21 
 
 
217 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  29.52 
 
 
192 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  33.33 
 
 
211 aa  51.6  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  31.54 
 
 
202 aa  51.2  0.000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  32.08 
 
 
193 aa  50.8  0.000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  36.96 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  33.75 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  34.34 
 
 
205 aa  48.1  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  33.75 
 
 
84 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0590  phage baseplate assembly protein V  31.54 
 
 
189 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  35 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  32.29 
 
 
211 aa  47.8  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  27.35 
 
 
194 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  28.04 
 
 
213 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  32.61 
 
 
196 aa  44.7  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  31.96 
 
 
213 aa  44.3  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0194  phage baseplate assembly protein V  26.83 
 
 
234 aa  44.3  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.263934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4849  phage baseplate assembly protein V  24.41 
 
 
210 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1868  phage baseplate assembly protein V  29.11 
 
 
226 aa  40.4  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  27.38 
 
 
187 aa  40.4  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>