9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_0649 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_0649  TraC family protein  100 
 
 		 95 aa  189  1e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5002  TraC family protein  53.95 
 
 		 77 aa  79.7  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.771758  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4333  putative TraC conjugal transfer protein  55.41 
 
 		 74 aa  67  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.57449  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8049  conjugal transfer protein TraC  37.35 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8130  conjugal transfer protein TraC  37.35 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.852257  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4674  conjugal transfer protein TraC  34.12 
 
 		 86 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.267648  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5051  conjugal transfer protein TraC  36.51 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5394  conjugal transfer protein TraC  36.51 
 
 		 98 aa  40.4  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809119  normal  0.482901 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9188  conjugal transfer protein Dtr system  31.76 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>