43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_2505 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  100 
 
 		 85 aa  169  1e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  87.8 
 
 		 85 aa  146  9e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  87.8 
 
 		 92 aa  144  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  85.19 
 
 		 96 aa  141  3e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  82.35 
 
 		 92 aa  140  5e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  80.49 
 
 		 92 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  80.49 
 
 		 88 aa  131  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  60.76 
 
 		 109 aa  104  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  57.65 
 
 		 86 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  60.49 
 
 		 96 aa  96.7  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  56.47 
 
 		 86 aa  96.7  1e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  55.42 
 
 		 106 aa  92.8  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  54.22 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  54.22 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  52.94 
 
 		 91 aa  89.4  1e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  55.13 
 
 		 82 aa  84.7  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  50 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  53.09 
 
 		 102 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  56.58 
 
 		 88 aa  84.7  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  55.13 
 
 		 80 aa  84  6e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  49.37 
 
 		 96 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  51.28 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  51.28 
 
 		 82 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  48.75 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  49.33 
 
 		 94 aa  80.5  0.000000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  56.79 
 
 		 108 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  45 
 
 		 93 aa  79.3  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  42.5 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  51.28 
 
 		 87 aa  78.2  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  42.5 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  50 
 
 		 79 aa  76.6  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  46.91 
 
 		 84 aa  71.2  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  44.87 
 
 		 88 aa  67.4  0.00000000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  42.86 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  48.05 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  41.98 
 
 		 86 aa  55.1  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  48.05 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  36.84 
 
 		 107 aa  51.6  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  42.47 
 
 		 117 aa  50.1  0.000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0675  hypothetical protein  32.81 
 
 		 88 aa  45.1  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  39.47 
 
 		 122 aa  43.9  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0125  hypothetical protein  36 
 
 		 100 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0596  protein of unknown function DUF526  35.9 
 
 		 83 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.60187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>