21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1569 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  385  1e-106  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  72.97 
 
 
172 aa  66.2  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  57.14 
 
 
201 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  68.89 
 
 
223 aa  59.3  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  42.86 
 
 
209 aa  58.2  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  64.86 
 
 
235 aa  55.1  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  59.52 
 
 
141 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  59.52 
 
 
139 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  59.52 
 
 
139 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  61.36 
 
 
138 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  66.67 
 
 
140 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  51.11 
 
 
141 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  77.78 
 
 
134 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  58.54 
 
 
129 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  74.07 
 
 
127 aa  49.7  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  65.62 
 
 
196 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  72.41 
 
 
230 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  57.14 
 
 
128 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  68 
 
 
135 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2744  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  34.25 
 
 
150 aa  41.6  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.700957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>