14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1551 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  264  2.9999999999999995e-70  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  42.57 
 
 
146 aa  99.8  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  46.21 
 
 
146 aa  94  7e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  40.65 
 
 
173 aa  82.8  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  38.46 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3389  hypothetical protein  41.54 
 
 
165 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.248941  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  40.69 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  29.5 
 
 
151 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  26.57 
 
 
137 aa  49.7  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  35.56 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0418  hypothetical protein  27.13 
 
 
202 aa  46.6  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  32.82 
 
 
149 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4928  hypothetical protein  28.67 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.936975  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  30.08 
 
 
136 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>