33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0407 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_0407  hypothetical protein  100 
 
 		 289 aa  588  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.467688 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0503  hypothetical protein  80.16 
 
 		 286 aa  428  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0544  hypothetical protein  62.13 
 
 		 333 aa  335  7e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.520266 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7547  hypothetical protein  60.08 
 
 		 258 aa  334  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0282  hypothetical protein  56.72 
 
 		 293 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.108801 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0493  hypothetical protein  58.73 
 
 		 290 aa  326  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.500337  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0547  hypothetical protein  53.45 
 
 		 296 aa  323  2e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0653377 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1938  hypothetical protein  39.68 
 
 		 287 aa  204  1e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.208921  normal  0.0147778 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1857  hypothetical protein  37.88 
 
 		 273 aa  163  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746248 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4517  hypothetical protein  38.79 
 
 		 287 aa  161  2e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0243839  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4859  hypothetical protein  38.82 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.332433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4907  hypothetical protein  38.82 
 
 		 298 aa  154  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.904735  normal  0.713064 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3666  hypothetical protein  37.87 
 
 		 287 aa  154  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000879372 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4396  hypothetical protein  38.82 
 
 		 306 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.558315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3592  hypothetical protein  34.6 
 
 		 288 aa  152  7e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.456108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3702  hypothetical protein  35.74 
 
 		 311 aa  150  3e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.317768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2555  putative signal peptide protein  32.28 
 
 		 258 aa  126  4.0000000000000003e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.709242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0172  hypothetical protein  33.05 
 
 		 275 aa  123  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0152845  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4587  hypothetical protein  33.47 
 
 		 280 aa  123  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0428092  normal  0.0490486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0919  hypothetical protein  29.34 
 
 		 276 aa  105  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.40379  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1704  hypothetical protein  29.92 
 
 		 297 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.624159  normal  0.112956 
 
 
-
 
NC_004310  BR2016  hypothetical protein  26.32 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.915492  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1940  hypothetical protein  26.32 
 
 		 271 aa  100  3e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3585  hypothetical protein  31.37 
 
 		 258 aa  94.7  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0908002 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3878  hypothetical protein  30.15 
 
 		 260 aa  90.1  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0512827 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4040  hypothetical protein  27.04 
 
 		 263 aa  89.4  7e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2639  hypothetical protein  27.14 
 
 		 292 aa  84.7  0.000000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2291  hypothetical protein  28.5 
 
 		 259 aa  79.7  0.00000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.429146  normal  0.89015 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3078  hypothetical protein  26.5 
 
 		 255 aa  78.2  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.186835  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0724  hypothetical protein  28.7 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.188626  normal  0.512508 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2014  hypothetical protein  28.7 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3112  hypothetical protein  29.23 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.108531  hitchhiker  0.00759909 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2581  hypothetical protein  25.1 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.132118  hitchhiker  0.00012432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>