15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0259 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_0259  hypothetical protein  100 
 
 
293 aa  615  1e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4937  hypothetical protein  71.63 
 
 
336 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2840  hypothetical protein  51.42 
 
 
329 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1693  hypothetical protein  31.25 
 
 
315 aa  88.6  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2402  hypothetical protein  35.66 
 
 
413 aa  79.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183698  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0265  hypothetical protein  34.91 
 
 
154 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0873  hypothetical protein  35.09 
 
 
345 aa  73.2  0.000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3571  hypothetical protein  37.84 
 
 
318 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.926328  normal  0.145277 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2162  hypothetical protein  32.79 
 
 
439 aa  65.5  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5757  hypothetical protein  24.68 
 
 
436 aa  49.3  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0164  hypothetical protein  34.57 
 
 
936 aa  47.8  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3763  hypothetical protein  31.78 
 
 
444 aa  45.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.493237  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3754  hypothetical protein  35.56 
 
 
320 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00430  hypothetical protein  28.04 
 
 
936 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0433  hypothetical protein  25 
 
 
444 aa  42.7  0.007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.374526 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>