30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4609 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4609  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  202  2e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5681  hypothetical protein  35.71 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.150981  normal  0.858407 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2257  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0271155  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2361  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1726  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2377  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.809061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2338  hypothetical protein  34.29 
 
 
80 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0939  hypothetical protein  34.78 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.02047  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4493  hypothetical protein  52.27 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1358  hypothetical protein  36.51 
 
 
131 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.92446  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4478  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0790  hypothetical protein  50 
 
 
65 aa  46.2  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.185376  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3901  hypothetical protein  48.21 
 
 
65 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0075  hypothetical protein  36.92 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.398237  normal  0.423709 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1943  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.153284  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3933  hypothetical protein  51.28 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.174427 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3820  hypothetical protein  51.28 
 
 
59 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0432882  normal  0.337677 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1322  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.747526  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1010  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.652393  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0293  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.984016  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1171  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0222478  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1163  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0855  hypothetical protein  42.11 
 
 
79 aa  44.7  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0959  hypothetical protein  39.47 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.134343  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1224  hypothetical protein  31.25 
 
 
81 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2108  hypothetical protein  35.9 
 
 
74 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.22897 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3322  hypothetical protein  35.9 
 
 
79 aa  40.4  0.008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.443037  normal  0.594787 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6400  hypothetical protein  47.37 
 
 
65 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.916024  normal  0.116761 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1076  hypothetical protein  38.81 
 
 
70 aa  40  0.01  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000323708  normal  0.411942 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5821  hypothetical protein  37.74 
 
 
65 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>