30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3029 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3029  hypothetical protein  100 
 
 		 127 aa  249  8.000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0129  hypothetical protein  43.61 
 
 		 139 aa  82.8  0.000000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0704993  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6425  hypothetical protein  42.34 
 
 		 154 aa  80.9  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2222  hypothetical protein  44.72 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1449  hypothetical protein  42.59 
 
 		 162 aa  69.3  0.00000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3045  hypothetical protein  38.26 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3104  hypothetical protein  38.26 
 
 		 137 aa  63.5  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3177  hypothetical protein  39.06 
 
 		 171 aa  63.2  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.421028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3061  hypothetical protein  38.26 
 
 		 137 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.130056  normal  0.220176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3594  hypothetical protein  37.19 
 
 		 136 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.32654  normal  0.529723 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0371  hypothetical protein  43.24 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37992e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2938  hypothetical protein  43.52 
 
 		 145 aa  61.6  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.904567 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5433  hypothetical protein  40.95 
 
 		 141 aa  59.7  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00625909  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1988  hypothetical protein  45.1 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1885  hypothetical protein  37.6 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0572068  normal  0.900072 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2876  putative transmembrane protein  45.79 
 
 		 142 aa  57.8  0.00000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000745882  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0847  hypothetical protein  36.45 
 
 		 170 aa  57  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11632  hypothetical protein  36.84 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.079961 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5672  hypothetical protein  39.47 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2011  hypothetical protein  44.44 
 
 		 124 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.837589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4717  hypothetical protein  38.71 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.729727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2821  hypothetical protein  36.44 
 
 		 137 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.650851  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1387  hypothetical protein  34.15 
 
 		 200 aa  52.4  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14880  hypothetical protein  42.39 
 
 		 155 aa  51.2  0.000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0219247  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1345  hypothetical protein  38.55 
 
 		 222 aa  50.4  0.000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.405691  decreased coverage  0.0000428453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2234  hypothetical protein  28.93 
 
 		 221 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687189 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1163  hypothetical protein  40.37 
 
 		 154 aa  48.9  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567834  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4905  hypothetical protein  48.39 
 
 		 140 aa  48.9  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.159227  hitchhiker  0.00546227 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0650  hypothetical protein  37.88 
 
 		 105 aa  45.4  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00148842  normal  0.176978 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1720  hypothetical protein  27.78 
 
 		 130 aa  41.2  0.005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000883152  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>