19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2523 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  100 
 
 
242 aa  474  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  42.54 
 
 
238 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  42.11 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  40.45 
 
 
258 aa  111  8.000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  35.51 
 
 
270 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  37.44 
 
 
239 aa  107  1e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  35.02 
 
 
256 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  37.21 
 
 
230 aa  97.1  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  39.44 
 
 
236 aa  96.7  3e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  37.5 
 
 
180 aa  94.4  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  32.79 
 
 
281 aa  82.8  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  31.73 
 
 
272 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  37.67 
 
 
301 aa  72.4  0.000000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  35.14 
 
 
219 aa  70.5  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  31.8 
 
 
248 aa  66.2  0.0000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  29.25 
 
 
253 aa  62.4  0.000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  29.11 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  31.48 
 
 
284 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  31.01 
 
 
254 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>