170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_AR0016 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007614  Nmul_AR0016  5S ribosomal RNA  100 
 
 		 118 bp  234  4.0000000000000004e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0050  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0060  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0074  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_R0079  5S ribosomal RNA  88.57 
 
 		 114 bp  75.8  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.810647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS00493  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0275686  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RS05582  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00903863  normal  0.193951 
 
 
-
 
NC_003295  RS05739  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0893083  normal  0.824943 
 
 
-
 
NC_003296  RS05424  ribosomal RNA-5S  85.39 
 
 		 114 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.133858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0066  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.506622  normal  0.0321697 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_R0060  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166079  normal  0.534885 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0055  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0054  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 112 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0044  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_R0043  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 112 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0051  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.344067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_R0041  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 113 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.742431 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_R0065  5S ribosomal RNA  85.39 
 
 		 112 bp  73.8  0.000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.509786  normal  0.0321697 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0006  5S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 114 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000910562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0053  5S ribosomal RNA  85.42 
 
 		 114 bp  71.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0013  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.418621 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0048  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 133 bp  69.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_R0058  5S ribosomal RNA  84.21 
 
 		 113 bp  69.9  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.639395  normal  0.537151 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0004  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0020  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.836189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_R0038  5S ribosomal RNA  87.14 
 
 		 113 bp  67.9  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0010  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.166624  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA_5s_rrfB  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.165355  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SC  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0456447  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA_Bm5SD  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00449174  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0065  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0006  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.723567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0075  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0262155  hitchhiker  0.00115285 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0077  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.552404  normal  0.045853 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0015  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.260373  hitchhiker  0.00590134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0050  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276696  hitchhiker  0.00248149 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0001  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  unclonable  0.0000000000461312  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1477  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.158261  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3558  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0127005  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1912  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0150114  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0055  5S ribosomal RNA  88.33 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0054  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0016  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.966007  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0029  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0106162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0070  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0998455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_AR0080  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000339218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0005  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.47652  normal  0.759465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0011  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.52779  normal  0.472403 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_BR0016  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 114 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000150605  normal  0.0430285 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0003  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0015  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.968472  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0064  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_R0053  5S ribosomal RNA  85 
 
 		 112 bp  63.9  0.000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0005  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0988602  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3105  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0639464  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0007  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00293377  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0925  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00633245  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1991  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0152339  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1332  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.68325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3539  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.530796  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3768  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000000330068  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0595  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.884038  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1341  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.608351  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3565  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 117 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.35308  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3829  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.336561  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0498  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0907  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.424601  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1894  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 118 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0186999  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3544  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 116 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_R0060  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000000127508  hitchhiker  0.000000693164 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_R0013  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000286071  normal  0.223631 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_R0070  5S ribosomal RNA  89.29 
 
 		 113 bp  63.9  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0195092  hitchhiker  0.00000402185 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0037  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.141863  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0007  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.718025  normal  0.0200825 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_R0052  5S ribosomal RNA  94.87 
 
 		 114 bp  61.9  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.790118 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0010  5S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 113 bp  61.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.705178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0051  5S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 113 bp  61.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_R0061  5S ribosomal RNA  83.16 
 
 		 113 bp  61.9  0.00000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00521103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_R0086  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0011  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 112 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000918889  normal  0.089753 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_R0001  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 112 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0023  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0267616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_CR0088  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322083  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0009  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0019  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000864469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0029  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.401927  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_AR0071  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_R0076  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.885608  normal  0.494732 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0065  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0004  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0036  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0051  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0062  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0224651  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_R0075  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_R0087  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0001  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 86 bp  58  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.431596  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0011  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.000846557  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0021  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.19891  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_R0063  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 97 bp  58  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0660998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_R0008  5S ribosomal RNA  94.59 
 
 		 113 bp  58  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000880421  hitchhiker  0.00620133 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>