17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1518 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1518  hypothetical protein  100 
 
 
151 aa  308  2e-83  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00559169 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3920  hypothetical protein  33.85 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.879955  normal  0.416027 
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4940  hypothetical protein  35.22 
 
 
173 aa  70.5  0.000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000844553  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0329  hypothetical protein  32.33 
 
 
130 aa  63.5  0.0000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00304499  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1551  hypothetical protein  29.5 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.646726  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0418  hypothetical protein  32.26 
 
 
202 aa  58.2  0.00000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3592  hypothetical protein  29.79 
 
 
146 aa  58.2  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3755  hypothetical protein  26.28 
 
 
226 aa  56.2  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.473381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3177  hypothetical protein  26.76 
 
 
146 aa  52.8  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3017  hypothetical protein  23.13 
 
 
136 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.196092  normal  0.052376 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6261  hypothetical protein  30.21 
 
 
160 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3865  hypothetical protein  30.95 
 
 
236 aa  50.8  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0127474 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1938  protein of unknown function DUF437  29.57 
 
 
172 aa  48.9  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2114  hypothetical protein  29.87 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.431354 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5358  hypothetical protein  27.78 
 
 
215 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757362  normal  0.121882 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1753  hypothetical protein  27.45 
 
 
149 aa  41.2  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3107  hypothetical protein  28.85 
 
 
157 aa  41.2  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000543353  decreased coverage  0.0000114562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>