10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1428 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1428  THUMP domain-containing protein  100 
 
 		 173 aa  340  8e-93  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0214  THUMP domain-containing protein  37.06 
 
 		 190 aa  117  6e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1953  THUMP domain-containing protein  34.13 
 
 		 178 aa  98.2  5e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0341  THUMP domain-containing protein  33.33 
 
 		 184 aa  91.3  6e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1164  THUMP domain-containing protein  32.75 
 
 		 175 aa  89  3e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1311  THUMP domain-containing protein  31.36 
 
 		 177 aa  87.8  7e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.011341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1784  THUMP domain-containing protein  31.95 
 
 		 174 aa  87.4  1e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.386874 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1772  THUMP domain-containing protein  32.14 
 
 		 369 aa  45.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.375193  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2940  hypothetical protein  23.27 
 
 		 179 aa  43.5  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000102757  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43859  predicted protein  27.89 
 
 		 327 aa  43.5  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.00122595  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>