18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0620 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  100 
 
 		 581 aa  1201    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  28.57 
 
 		 618 aa  112  2.0000000000000002e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  24.95 
 
 		 580 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  26.58 
 
 		 619 aa  103  8e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  23.92 
 
 		 579 aa  99  2e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  23.19 
 
 		 578 aa  99.4  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 576 aa  94  7e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  25.16 
 
 		 583 aa  89.4  2e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  24.94 
 
 		 544 aa  82.8  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  22.92 
 
 		 536 aa  82.4  0.00000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  24.58 
 
 		 578 aa  81.6  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  22.16 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  25.37 
 
 		 533 aa  72.4  0.00000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  20.41 
 
 		 535 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  19.71 
 
 		 536 aa  67.4  0.0000000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  22.38 
 
 		 589 aa  66.6  0.000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  24.15 
 
 		 566 aa  64.7  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  21.68 
 
 		 538 aa  55.1  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>