10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0464 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0464  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  400  1e-111  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000221199 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0453  hypothetical protein  30.48 
 
 
201 aa  94.7  7e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000000000453339 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1620  hypothetical protein  30.94 
 
 
202 aa  86.3  3e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2686  hypothetical protein  25.77 
 
 
119 aa  51.2  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.463238  normal  0.104568 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1662  hypothetical protein  29.29 
 
 
125 aa  49.7  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.293702  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0690  hypothetical protein  23.28 
 
 
128 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1969  hypothetical protein  28.21 
 
 
131 aa  47.8  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.88465  normal  0.0475375 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3591  hypothetical protein  26.09 
 
 
125 aa  46.2  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0723  transcriptional regulator, ArsR family  23.96 
 
 
116 aa  42.4  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.532728  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5206  hypothetical protein  29.03 
 
 
121 aa  42  0.006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>