19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_2924 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013922  Nmag_2924  nucleic acid-binding protein  100 
 
 
160 aa  328  2e-89  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3256  nucleic acid-binding protein  80.13 
 
 
163 aa  272  1.0000000000000001e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2595  PilT domain-containing protein  37.33 
 
 
132 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.528946  normal  0.129291 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2684  PilT protein domain protein  37.09 
 
 
132 aa  73.9  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285595  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1712  hypothetical protein  36.25 
 
 
167 aa  73.6  0.000000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0447  PilT protein-like  34.21 
 
 
135 aa  68.6  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.162759  normal  0.289411 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3221  hypothetical protein  32.89 
 
 
134 aa  68.9  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2132  PilT protein-like  31.33 
 
 
133 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0313622  normal  0.0299917 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1457  PilT protein domain protein  29.61 
 
 
135 aa  57.4  0.00000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.767558  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1364  hypothetical protein  27.92 
 
 
134 aa  56.6  0.0000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1920  PilT protein  30.52 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.192061  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2562  PilT domain-containing protein  32.24 
 
 
135 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.828362  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00062  PIN domain, putative  27.27 
 
 
136 aa  52.4  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0134903  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0256  hypothetical protein  25.49 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0226  hypothetical protein  25.49 
 
 
132 aa  51.2  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1838  hypothetical protein  24.18 
 
 
132 aa  50.8  0.000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0778721  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3167  PilT domain-containing protein  26.97 
 
 
135 aa  47.8  0.00007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000731556  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2739  PilT protein domain protein  29.87 
 
 
136 aa  46.2  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.517904  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3219  putative nucleic acid-binding PilT-like protein  25.79 
 
 
137 aa  42  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.54607 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>