25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3811 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3811  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  253  6e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0228634  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2716  BA14K family protein  81.48 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.263756  normal  0.415615 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2421  BA14K family protein  81.48 
 
 		 141 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.92837  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2493  BA14K family protein  81.48 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.279471 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5379  BA14K family protein  77.78 
 
 		 129 aa  51.6  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0536117 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4232  hypothetical protein  56.41 
 
 		 235 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.350576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3033  hypothetical protein  57.5 
 
 		 201 aa  50.4  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2889  hypothetical protein  72.41 
 
 		 196 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.00745568  normal  0.0488886 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0685  hypothetical protein  76 
 
 		 126 aa  48.9  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.504453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3174  hypothetical protein  57.58 
 
 		 135 aa  48.9  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.798003  normal  0.0785982 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1942  hypothetical protein  33.61 
 
 		 128 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0593  hypothetical protein  72 
 
 		 127 aa  47.4  0.00006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.667987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2698  putative exported protein of unknown function  68.97 
 
 		 209 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0170396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2082  hypothetical protein  54.05 
 
 		 172 aa  46.6  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.25175  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0272  hypothetical protein  65.52 
 
 		 138 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2464  hypothetical protein  52.5 
 
 		 230 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0984361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2417  hypothetical protein  55.56 
 
 		 223 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.12503  normal  0.0235404 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1123  BA14K-like  52.63 
 
 		 141 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0534  hypothetical protein  52.27 
 
 		 153 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5051  hypothetical protein  66.67 
 
 		 134 aa  44.3  0.0005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.567981  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1022  BA14K-like  62.96 
 
 		 140 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2137  hypothetical protein  73.08 
 
 		 129 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.150789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2136  hypothetical protein  73.08 
 
 		 210 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129106  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1569  hypothetical protein  50 
 
 		 211 aa  41.2  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3004  BA14K family protein  36.51 
 
 		 150 aa  40.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>