42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3333 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3333  Phage-related baseplate assembly protein V  100 
 
 		 175 aa  350  5.9999999999999994e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2384  Phage-related baseplate assembly protein V  93.06 
 
 		 174 aa  310  5.999999999999999e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0194  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2302  phage-related baseplate assembly protein V  56.74 
 
 		 145 aa  168  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.580845  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1500  Phage P2 baseplate assembly protein GPV-like protein  41.03 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.889944  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2341  phage baseplate assembly protein V  36.7 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.962217  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1337  hypothetical protein  37.23 
 
 		 226 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.19388  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0642  prophage LambdaW5, baseplate assembly protein V  32.99 
 
 		 154 aa  61.6  0.000000006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.392908  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1294  phage baseplate assembly protein V  36.28 
 
 		 125 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.455231 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2324  hypothetical protein  33.04 
 
 		 180 aa  60.5  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.711911  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0738  Phage baseplate assembly protein V  30.06 
 
 		 186 aa  57.4  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2902  phage baseplate assembly protein V  45.74 
 
 		 202 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.684601 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37480  Phage P2 baseplate assembly gpV-like protein  39.13 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3488  phage baseplate assembly protein V  34.38 
 
 		 213 aa  54.7  0.0000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0856237 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1925  phage baseplate assembly-like protein  36 
 
 		 205 aa  53.9  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.405057 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3037  phage baseplate assembly protein V  34.02 
 
 		 192 aa  53.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000236294 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2183  baseplate assembly protein V, truncation  37.35 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2069  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  52.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000543099  hitchhiker  0.0000457319 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3822  phage baseplate assembly protein V  38.32 
 
 		 193 aa  53.5  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2652  phage baseplate assembly protein V  34.74 
 
 		 194 aa  53.1  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0950236  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1388  Phage-related baseplate assembly protein V  35.48 
 
 		 221 aa  52.4  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.595566  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2854  phage baseplate assembly protein V  32.99 
 
 		 192 aa  52.8  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2296  baseplate assembly protein V  35.16 
 
 		 119 aa  52  0.000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.107943  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3300  phage baseplate assembly protein V  34.07 
 
 		 217 aa  51.2  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3039  phage baseplate assembly protein GpV  29.41 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000239621 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00841  hypothetical protein  34.15 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2765  phage baseplate assembly protein V  35.9 
 
 		 192 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000252262 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1827  phage baseplate assembly protein V  27.95 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0087576  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0869  phage baseplate assembly protein V  33.71 
 
 		 211 aa  49.3  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0625663 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4337  phage baseplate assembly protein GpV  28.68 
 
 		 211 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0120707 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1633  phage-related baseplate assembly protein V  30.37 
 
 		 194 aa  48.5  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3187  phage baseplate assembly protein V  32.97 
 
 		 213 aa  48.5  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.701564  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0936  phage baseplate assembly protein V  35.9 
 
 		 192 aa  48.1  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0682  hypothetical protein  28.83 
 
 		 206 aa  47.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00847  hypothetical protein  34.62 
 
 		 192 aa  47  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4377  baseplate assembly protein V  34.07 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000317032 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01346  phage-related baseplate protein  33.7 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.261049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1937  baseplate assembly protein V  31.31 
 
 		 193 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2090  phage baseplate assembly protein V  25 
 
 		 213 aa  44.3  0.0009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.041892  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0893  phage baseplate assembly protein V  34.41 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.176645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2637  phage baseplate assembly protein V  31.18 
 
 		 241 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0616276  hitchhiker  0.000571581 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2603  phage baseplate assembly protein V  31.18 
 
 		 217 aa  43.1  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0154554  hitchhiker  0.000000000000278565 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01988  hypothetical protein  28 
 
 		 212 aa  41.2  0.007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>