13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2655 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2655  hypothetical protein  100 
 
 		 271 aa  545  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1480  hypothetical protein  33.51 
 
 		 276 aa  53.5  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.753593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  36 
 
 		 296 aa  49.3  0.00007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0242  virulence-associated protein E  34.85 
 
 		 293 aa  48.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0719  hypothetical protein  30.45 
 
 		 346 aa  48.1  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0812482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1217  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.046593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3518  hypothetical protein  31.88 
 
 		 344 aa  45.8  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.818052  normal  0.966991 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2291  hypothetical protein  31.48 
 
 		 336 aa  42.7  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.237605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1532  hypothetical protein  32.93 
 
 		 344 aa  42.7  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0877036 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5271  virulence-associated protein E  31.13 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.569281 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6192  hypothetical protein  30.73 
 
 		 344 aa  42.4  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00206516  normal  0.0205982 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1915  hypothetical protein  37.35 
 
 		 914 aa  42.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3175  hypothetical protein  31.14 
 
 		 347 aa  42  0.01  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.461853  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>