18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2511 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007964  Nham_2511  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  527  1e-149  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1644  hypothetical protein  39.68 
 
 
244 aa  92  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0529  hypothetical protein  36.29 
 
 
233 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.509897  normal  0.851974 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1485  hypothetical protein  36.07 
 
 
235 aa  80.1  0.00000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2206  hypothetical protein  37.4 
 
 
230 aa  79  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398121  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3541  hypothetical protein  38.06 
 
 
246 aa  78.2  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1851  hypothetical protein  31.78 
 
 
238 aa  67.4  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.214154  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3633  hypothetical protein  32.62 
 
 
259 aa  58.5  0.00000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0392444  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0538  hypothetical protein  33.86 
 
 
240 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1349  hypothetical protein  28.97 
 
 
253 aa  53.9  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.493253 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3759  hypothetical protein  48.08 
 
 
271 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0033  hypothetical protein  29.59 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.809592 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2525  hypothetical protein  22.45 
 
 
242 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.14127  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4121  hypothetical protein  31.41 
 
 
220 aa  47.4  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1469  hypothetical protein  42.59 
 
 
207 aa  47  0.0003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.469762  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1406  hypothetical cytosolic protein  40 
 
 
139 aa  46.6  0.0004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00387879  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0628  hypothetical protein  45.65 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.141009 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0461  hypothetical protein  38.81 
 
 
261 aa  42.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>