66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2161 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2161  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 		 231 aa  460  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1638  phosphoesterase, PA-phosphatase related  80.43 
 
 		 270 aa  387  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176465  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0824  phosphoesterase, PA-phosphatase related  32.75 
 
 		 235 aa  68.2  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3315  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.49 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5353  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.82 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4812  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.82 
 
 		 241 aa  62  0.000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0424585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6062  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.92 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0884103 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.05 
 
 		 235 aa  60.8  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5470  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.59 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5391  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.59 
 
 		 241 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0184  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.18 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0788645 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4799  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.18 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5614  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.07 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287083  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.35 
 
 		 232 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2161  efflux channel  30.56 
 
 		 235 aa  60.1  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.85 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0055  undecaprenyl-diphosphatase  33.86 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0021  PAP2 family protein  31.25 
 
 		 220 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.42598  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0753  phosphoesterase PA-phosphatase related  25 
 
 		 230 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  30 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.45 
 
 		 176 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  28.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  29.17 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  26.83 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  27.64 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  26.83 
 
 		 199 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  26.39 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.42 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  26.49 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13960  membrane-associated phospholipid phosphatase  37.65 
 
 		 390 aa  45.8  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66242  normal  0.948702 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  31.78 
 
 		 187 aa  45.8  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.58 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7181  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.38 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.495224 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.11 
 
 		 199 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  26.67 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.22 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3318  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.16 
 
 		 208 aa  44.7  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0711194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.06 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.22 
 
 		 198 aa  45.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  27.56 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  27.22 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  27.22 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2444  hypothetical protein  45.16 
 
 		 216 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0113795  normal  0.0207864 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.44 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25 
 
 		 224 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.22 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  34.09 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1131  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.28 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.22 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.22 
 
 		 198 aa  43.9  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30 
 
 		 201 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  39.34 
 
 		 180 aa  43.5  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  37.66 
 
 		 194 aa  43.5  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  27.34 
 
 		 199 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0111  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.09 
 
 		 174 aa  42.7  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1491  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.29 
 
 		 157 aa  42.4  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0940557  normal  0.0672657 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2382  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.23 
 
 		 221 aa  42.7  0.005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000279179  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2147  phosphoesterase PA-phosphatase related  37.5 
 
 		 178 aa  42  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.913624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  36.36 
 
 		 211 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  36.36 
 
 		 211 aa  42  0.009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>