126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4812 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_4812  phosphoesterase, PA-phosphatase related  100 
 
 
241 aa  488  1e-137  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0424585  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5353  phosphoesterase PA-phosphatase related  99.57 
 
 
231 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0184  phosphoesterase, PA-phosphatase related  93.45 
 
 
230 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0788645 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3315  phosphoesterase PA-phosphatase related  89.33 
 
 
230 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5391  phosphoesterase, PA-phosphatase related  87.39 
 
 
241 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5470  phosphoesterase, PA-phosphatase related  87.39 
 
 
241 aa  409  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4799  phosphoesterase PA-phosphatase related  90.39 
 
 
230 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5614  phosphoesterase PA-phosphatase related  61.67 
 
 
230 aa  294  1e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287083  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6062  phosphoesterase PA-phosphatase related  60.62 
 
 
230 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0884103 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  57.21 
 
 
232 aa  259  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0824  phosphoesterase, PA-phosphatase related  39.78 
 
 
235 aa  125  8.000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  43.75 
 
 
235 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2161  efflux channel  43.12 
 
 
235 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0753  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.91 
 
 
230 aa  74.3  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534129  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2161  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.11 
 
 
231 aa  69.3  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  28.66 
 
 
199 aa  62.8  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.66 
 
 
199 aa  62.4  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.66 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1638  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.2 
 
 
270 aa  60.8  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176465  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.03 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  29.93 
 
 
199 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  29.05 
 
 
199 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  29.85 
 
 
199 aa  55.1  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0735  PAP2 family protein  29.37 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0740  PAP2 family protein  28.67 
 
 
255 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  30.37 
 
 
187 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  30 
 
 
180 aa  51.6  0.00001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  28.12 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1477  hypothetical protein  37.07 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.769795  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1506  hypothetical protein  37.07 
 
 
204 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.7 
 
 
199 aa  50.8  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  28.33 
 
 
199 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3725  phosphoesterase, PA-phosphatase related  35.21 
 
 
158 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  30.07 
 
 
176 aa  50.4  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0488  undecaprenyl-diphosphatase  29.27 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.263915 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.71 
 
 
199 aa  50.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  27.1 
 
 
199 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3348  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.33 
 
 
186 aa  48.9  0.00006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.31592  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.67 
 
 
199 aa  49.3  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3000  PA-phosphatase-like phosphoesterase  31.62 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.30971 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4035  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  31.62 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4982  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase (Tn6048)  31.62 
 
 
198 aa  48.9  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504751  normal  0.3606 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.23 
 
 
202 aa  48.9  0.00007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  34.02 
 
 
187 aa  48.9  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.14 
 
 
178 aa  48.9  0.00007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2248  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  31.39 
 
 
182 aa  48.5  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2059  undecaprenyl-diphosphatase  37.84 
 
 
204 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  28.89 
 
 
183 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  28.33 
 
 
199 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  36.63 
 
 
267 aa  48.5  0.00009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0495  PAP2 superfamily protein  26.81 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3446  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.87 
 
 
267 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00808  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.85 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2801  Undecaprenyl-diphosphatase  31.85 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.185163  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  37.21 
 
 
207 aa  47.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00825  hypothetical protein  31.85 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0902  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.85 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0843231  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  45 
 
 
168 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2801  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.85 
 
 
198 aa  47.4  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.907509 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0994  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  29.32 
 
 
198 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.485972  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.64 
 
 
267 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1173  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.52 
 
 
183 aa  46.2  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0920806  normal  0.0722851 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.45 
 
 
199 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.48 
 
 
224 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.48 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.48 
 
 
202 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.4 
 
 
252 aa  45.8  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0868  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.11 
 
 
198 aa  45.8  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1669  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.33 
 
 
202 aa  45.8  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.0000000000273408  normal  0.218841 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  30.37 
 
 
224 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0912  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.11 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  27.91 
 
 
201 aa  45.4  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2504  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  31.11 
 
 
198 aa  45.4  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.8629  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.48 
 
 
224 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0639  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.96 
 
 
185 aa  45.4  0.0008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.198264  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0992  PAP2 family protein  39.13 
 
 
204 aa  44.7  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2128  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.25 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.167938  normal  0.900368 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2029  phosphoesterase, PA-phosphatase related  40 
 
 
200 aa  45.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0690  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.07 
 
 
236 aa  45.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2570  hypothetical protein  31.52 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484393  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.57 
 
 
212 aa  45.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2570  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  34.38 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.501729  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  30 
 
 
192 aa  45.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1798  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.09 
 
 
290 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000117501  normal  0.5376 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2201  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.66 
 
 
208 aa  45.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2407  inner membrane protein YeiU  30.6 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000750111 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2450  hypothetical protein  30.6 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.598328  hitchhiker  0.0000000794729 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2453  inner membrane protein YeiU  30.6 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00121295  normal  0.963661 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2362  inner membrane protein YeiU  30.6 
 
 
248 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000283776  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2564  inner membrane protein YeiU  30.6 
 
 
248 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  decreased coverage  0.00168101  hitchhiker  0.0000332566 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  23.76 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  23.76 
 
 
211 aa  43.9  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0154  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.13 
 
 
249 aa  44.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1700  phosphatidylglycerophosphatase B  37.97 
 
 
259 aa  44.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000559502  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4138  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.57 
 
 
499 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.11 
 
 
187 aa  44.3  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4462  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.13 
 
 
224 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0262508  normal  0.313668 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2061  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.16 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13960  membrane-associated phospholipid phosphatase  36.51 
 
 
390 aa  44.3  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.66242  normal  0.948702 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4399  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.13 
 
 
229 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>