70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2161 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007493  RSP_2161  efflux channel  100 
 
 
235 aa  459  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.258305  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0835  phosphoesterase, PA-phosphatase related  99.15 
 
 
235 aa  456  1e-127  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0824  phosphoesterase, PA-phosphatase related  79.06 
 
 
235 aa  384  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6467  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.67 
 
 
232 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.555163 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3315  phosphoesterase PA-phosphatase related  46.05 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.166704 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5470  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.14 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.111897 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5391  phosphoesterase, PA-phosphatase related  44.14 
 
 
241 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0488562  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4799  phosphoesterase PA-phosphatase related  44.14 
 
 
230 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0184  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.76 
 
 
230 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0788645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5614  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.61 
 
 
230 aa  116  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.287083  normal  0.473985 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6062  phosphoesterase PA-phosphatase related  39.31 
 
 
230 aa  115  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0884103 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5353  phosphoesterase PA-phosphatase related  42.07 
 
 
231 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.908048  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4812  phosphoesterase, PA-phosphatase related  42.07 
 
 
241 aa  113  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0424585  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0753  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.96 
 
 
230 aa  81.6  0.000000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.534129  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1638  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.16 
 
 
270 aa  72.8  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.176465  normal  0.666832 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2161  phosphoesterase, PA-phosphatase related  30.22 
 
 
231 aa  71.2  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2785  bacitracin transport permease  29.7 
 
 
199 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0349348  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2759  bacitracin transport permease protein bcrc  27.63 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0828321  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2497  bacitracin transport permease  29.09 
 
 
199 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000202307  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2918  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  31.12 
 
 
191 aa  57  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.547296  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2794  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.44 
 
 
199 aa  56.6  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.755209  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1456  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.07 
 
 
192 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2288  phosphoesterase PA-phosphatase related  29.17 
 
 
205 aa  54.3  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2462  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  27.63 
 
 
199 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0841769  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2631  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.47 
 
 
212 aa  52.8  0.000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0399  phosphatase  27.71 
 
 
187 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.556092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2665  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  25.14 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160204 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2391  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  25.14 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.193299  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2053  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.36 
 
 
199 aa  52  0.000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.400178  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2430  PAP2 family protein  25.27 
 
 
199 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000481219  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2716  bacitracin transport permease, PAP2 family protein  24.26 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.179676  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1713  phosphoesterase PA-phosphatase related  27.96 
 
 
176 aa  51.6  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.118972  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1775  phosphoesterase, PA-phosphatase related  27.23 
 
 
187 aa  50.4  0.00003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3788  phosphoesterase PA-phosphatase related  41.38 
 
 
169 aa  50.1  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2194  PAP2 family phosphatase  26.55 
 
 
183 aa  49.3  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000351549  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0795  PAP2 family protein  30.83 
 
 
193 aa  48.5  0.00008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0176796  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1634  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  28.24 
 
 
201 aa  48.5  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.550126  decreased coverage  0.000150878 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2317  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.5 
 
 
187 aa  47.8  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1480  undecaprenyl-diphosphatase  23.95 
 
 
180 aa  47.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00409552  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0466  phosphoesterase, PA-phosphatase related  36.14 
 
 
207 aa  46.6  0.0003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0243  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  32.39 
 
 
237 aa  46.6  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2635  bacitracin transport permease protein bcrc  26.86 
 
 
199 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000183943 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0783  PAP2 family protein  29.17 
 
 
193 aa  46.6  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.078196  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2678  Pap2 superfamily protein, putative  26.92 
 
 
199 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0129761  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0272  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  24.6 
 
 
188 aa  45.8  0.0005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2676  bacitracin transport permease protein bcrc  26.22 
 
 
199 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2292  phosphatase, PAP2 family protein  27.61 
 
 
194 aa  45.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000588398  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0969  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.22 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0901  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.22 
 
 
224 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0998  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.22 
 
 
202 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.51948  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0937  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  24.22 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1017  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.32 
 
 
224 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0729132  normal  0.570341 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0568  hypothetical protein  31.4 
 
 
187 aa  44.7  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.237091 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3387  phosphoesterase PA-phosphatase related  31 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000111833  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2489  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.11 
 
 
199 aa  44.3  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0315773  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2523  PAP2 family protein  27.61 
 
 
181 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000225597 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2059  undecaprenyl-diphosphatase  38.71 
 
 
204 aa  43.5  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0523127  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3574  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.67 
 
 
267 aa  43.1  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2508  PAP2 family protein  27.61 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1332  undecaprenyl pyrophosphate phosphatase  25.85 
 
 
202 aa  43.1  0.003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.130415 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2329  PAP2 family protein  27.61 
 
 
211 aa  43.5  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.401849  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0891  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  36.62 
 
 
199 aa  43.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.467652  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3250  phosphoesterase PA-phosphatase related  32.67 
 
 
267 aa  43.1  0.004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00807425 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0422  phosphoesterase PA-phosphatase related  33.64 
 
 
192 aa  42.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15070  PAP2 superfamily protein  36.15 
 
 
198 aa  42.7  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.872818 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2178  phosphoesterase, PA-phosphatase related  33.9 
 
 
166 aa  42.4  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0634  phosphoesterase, PA-phosphatase related  28.9 
 
 
178 aa  42.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000602311  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1888  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  33.33 
 
 
192 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.871384  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2844  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.29 
 
 
252 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.651448  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0878  phosphoesterase PA-phosphatase related  21.99 
 
 
182 aa  41.6  0.01  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.749948  hitchhiker  0.002123 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>