34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1377 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1377    100 
 
 		 416 bp  825    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.552993  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3015  transposase, mutator type  100 
 
 		 1224 bp  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1691    100 
 
 		 1225 bp  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0391354  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0110  transposase, mutator type  100 
 
 		 1224 bp  422  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335509  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4295    100 
 
 		 431 bp  414  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4163    91.5 
 
 		 306 bp  400  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6213    89.57 
 
 		 2705 bp  218  9e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5112  transposase, mutator type  88.42 
 
 		 1224 bp  202  6e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.540626  normal  0.120028 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0824    86.6 
 
 		 195 bp  178  8e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0817  transposase  88.81 
 
 		 711 bp  147  3e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2954  aspartate/glutamate/uridylate kinase  98.59 
 
 		 897 bp  133  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3212  transposase, mutator type  85.81 
 
 		 1224 bp  133  4.0000000000000003e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.49013  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0287  transposase, mutator type  84.52 
 
 		 1224 bp  117  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.286188  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3247  transposase, mutator type  85.4 
 
 		 1224 bp  113  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.203349  n/a   
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3615  transposase, mutator type  84.78 
 
 		 1224 bp  107  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0776  transposase, mutator type  84.78 
 
 		 1224 bp  107  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0805  transposase, mutator type  84.78 
 
 		 1224 bp  107  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3387  transposase, mutator type  84.67 
 
 		 1224 bp  105  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5439  transposase mutator type  85.6 
 
 		 1221 bp  105  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5434  transposase, mutator type  83.67 
 
 		 366 bp  101  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009471  Acry_3613  transposase, mutator type  84.06 
 
 		 1128 bp  99.6  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.230884  normal  0.701856 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8282  transposase for insertion sequence element isrm3  84.43 
 
 		 1221 bp  91.7  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2188  hypothetical protein  90.48 
 
 		 63 bp  77.8  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.441724  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1952    83.44 
 
 		 2579 bp  77.8  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2433  transposase mutator type  79.23 
 
 		 1227 bp  61.9  0.0000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.226553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0568  transposase  92.86 
 
 		 1260 bp  60  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2200  transposase  92.86 
 
 		 1260 bp  60  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0638  transposase  92.86 
 
 		 1260 bp  60  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0158  transposase  92.86 
 
 		 1260 bp  60  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.590957  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2213    78.69 
 
 		 660 bp  54  0.00003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0198469  normal  0.15875 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0254    90.24 
 
 		 2624 bp  50.1  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0149  transposase InsF  91.67 
 
 		 1236 bp  48.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6208    91.43 
 
 		 1202 bp  46.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6091    91.43 
 
 		 1196 bp  46.1  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>