71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0201 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1065  lysyl-tRNA synthetase  69.29 
 
 		 567 aa  780    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.115893 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0432  lysyl-tRNA synthetase  63.2 
 
 		 539 aa  694    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316721  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0017  lysyl-tRNA synthetase  67.17 
 
 		 553 aa  738    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2384  lysyl-tRNA synthetase  68.63 
 
 		 565 aa  756    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3971  lysyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 551 aa  660    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1360  lysyl-tRNA synthetase  61.82 
 
 		 553 aa  678    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0201  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 543 aa  1127    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1000  lysyl-tRNA synthetase  86.72 
 
 		 545 aa  993    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771898  normal  0.632109 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2980  lysyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 582 aa  709    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387429 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0730  lysyl-tRNA synthetase  88.66 
 
 		 546 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0137  lysyl-tRNA synthetase  59.46 
 
 		 552 aa  667    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1625  lysyl-tRNA synthetase  64.96 
 
 		 568 aa  704    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279844  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6283  lysyl-tRNA synthetase  64.73 
 
 		 567 aa  714    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0888  lysyl-tRNA synthetase  87.08 
 
 		 545 aa  995    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0503  lysyl-tRNA synthetase  59.85 
 
 		 550 aa  666    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0741  lysyl-tRNA synthetase  59.67 
 
 		 551 aa  656    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3162  lysyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 567 aa  706    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152215  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0151  lysyl-tRNA synthetase  94.28 
 
 		 543 aa  1064    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5166  lysyl-tRNA synthetase  87.25 
 
 		 545 aa  994    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3798  lysyl-tRNA synthetase  65.43 
 
 		 585 aa  724    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3206  lysyl-tRNA synthetase  65.47 
 
 		 567 aa  708    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7217  lysyl-tRNA synthetase  65.61 
 
 		 567 aa  711    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0790  lysyl-tRNA synthetase  59.48 
 
 		 551 aa  655    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0790  lysyl-tRNA synthetase  87.2 
 
 		 548 aa  989    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677714  hitchhiker  0.00421967 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0487  lysyl-tRNA synthetase  57.73 
 
 		 526 aa  627  1e-178  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.481224  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1321  lysyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 		 530 aa  621  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203772  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1576  lysyl-tRNA synthetase  58.54 
 
 		 530 aa  621  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286152  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2206  lysyl-tRNA synthetase  56.22 
 
 		 552 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.485423  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0584  lysyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 526 aa  618  1e-176  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135058  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2237  lysyl-tRNA synthetase  57.94 
 
 		 526 aa  619  1e-176  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0509  lysyl-tRNA synthetase  54.99 
 
 		 529 aa  592  1e-168  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2261  lysyl-tRNA synthetase  54.84 
 
 		 547 aa  590  1e-167  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3566  lysyl-tRNA synthetase  56.23 
 
 		 583 aa  588  1e-167  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279975  normal  0.84851 
 
 
-
 
NC_002978  WD0860  lysyl-tRNA synthetase  53.27 
 
 		 511 aa  590  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0707  lysyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 519 aa  579  1e-164  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0463  lysyl-tRNA synthetase  54.93 
 
 		 533 aa  578  1.0000000000000001e-163  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0614307  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3617  lysyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 548 aa  575  1.0000000000000001e-163  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.983213  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0268  lysyl-tRNA synthetase  56.1 
 
 		 540 aa  560  1e-158  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0782951  normal  0.684652 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2360  lysyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 534 aa  540  9.999999999999999e-153  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0626  lysyl-tRNA synthetase  50.19 
 
 		 511 aa  535  1e-151  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0413  lysyl-tRNA synthetase  49.25 
 
 		 511 aa  531  1e-149  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.738039  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0773  lysyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 		 505 aa  528  1e-148  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0578  lysyl-tRNA synthetase  29.44 
 
 		 529 aa  238  2e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0679  lysyl-tRNA synthetase  27.24 
 
 		 521 aa  158  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2815  lysyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 		 533 aa  156  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000378185  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2757  lysyl-tRNA synthetase  26.82 
 
 		 517 aa  152  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000778634 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2340  lysine--tRNA ligase, class I (lysyl-tRNA synthetase, class I)  26.99 
 
 		 517 aa  150  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2651  lysyl-tRNA synthetase  26.07 
 
 		 517 aa  147  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0307953  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1509  lysyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 568 aa  144  5e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2387  lysyl-tRNA synthetase  30.1 
 
 		 567 aa  143  8e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.353183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3478  lysyl-tRNA synthetase  26.14 
 
 		 553 aa  139  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2567  lysyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 		 517 aa  139  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2375  lysine--tRNA ligase (lysyl-tRNA synthetase)  25.05 
 
 		 517 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1293  lysyl-tRNA synthetase  30.79 
 
 		 600 aa  139  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1865  lysyl-tRNA synthetase  26.97 
 
 		 528 aa  133  6.999999999999999e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2180  lysyl-tRNA synthetase  27.39 
 
 		 492 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.02262  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1974  lysyl-tRNA synthetase  27.07 
 
 		 546 aa  131  3e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1507  lysyl-tRNA synthetase  25.68 
 
 		 537 aa  128  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0922  lysyl-tRNA synthetase  24.44 
 
 		 524 aa  127  7e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0275  lysyl-tRNA synthetase  24.2 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1355  lysyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0563  lysyl-tRNA synthetase  24.02 
 
 		 533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0629  lysyl-tRNA synthetase  25 
 
 		 533 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2553  lysyl-tRNA synthetase  23.85 
 
 		 528 aa  111  3e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.584812  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0116  lysyl-tRNA synthetase  23.77 
 
 		 505 aa  111  4.0000000000000004e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0215  lysyl-tRNA synthetase  21.76 
 
 		 545 aa  109  2e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273119  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1618  lysine--tRNA ligase  24.65 
 
 		 641 aa  107  8e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0773  lysyl-tRNA synthetase  25.65 
 
 		 497 aa  96.3  1e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4154  lysyl-tRNA synthetase  22.16 
 
 		 527 aa  94.7  4e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0571  lysyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 		 598 aa  93.6  9e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26496  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0786  lysyl-tRNA synthetase  23.84 
 
 		 537 aa  79.7  0.0000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.930737  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>