More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4669 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4669  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  100 
 
 
249 aa  495  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4667  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  72.27 
 
 
212 aa  281  1e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8763  hypothetical protein  63.73 
 
 
303 aa  270  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0076  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.86 
 
 
231 aa  205  7e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7232  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.59 
 
 
295 aa  193  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.729107 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1973  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  43.16 
 
 
277 aa  191  8e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4333  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.31 
 
 
274 aa  167  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0509  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  40.21 
 
 
287 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2395  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  43.67 
 
 
254 aa  124  1e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0161854  decreased coverage  0.00139428 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2688  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36.7 
 
 
292 aa  119  3.9999999999999996e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00428161  normal  0.0876475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5278  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  41.41 
 
 
132 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.299006  normal  0.352255 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5686  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.27 
 
 
273 aa  113  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3141  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.65 
 
 
238 aa  108  1e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.849599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8227  hypothetical protein  33.33 
 
 
261 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4659  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.46 
 
 
261 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0138559  normal  0.655955 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36030  Ykud domain-containing protein  35.06 
 
 
254 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.247142 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1795  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.61 
 
 
303 aa  92  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.717603  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4259  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.44 
 
 
233 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.098487  normal  0.642292 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2404  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  35.25 
 
 
112 aa  87.4  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2407  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.13 
 
 
193 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.644792  decreased coverage  0.00106485 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5420  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.61 
 
 
199 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421702  normal  0.723752 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3616  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.68 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3372  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 
165 aa  65.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4899  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4743  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5274  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5187  hypothetical protein  27.94 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5143  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5172  hypothetical protein  27.94 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4762  hypothetical protein  28.91 
 
 
153 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1663  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  33.61 
 
 
283 aa  63.9  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.23 
 
 
411 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000751939 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3222  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.84 
 
 
165 aa  63.5  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0633  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.47 
 
 
253 aa  62.8  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00165646  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5178  hypothetical protein  29.13 
 
 
153 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0812  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.99 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0578  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.4 
 
 
228 aa  61.6  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.293913  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0072  hypothetical protein  28.35 
 
 
153 aa  61.2  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4858  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.35 
 
 
153 aa  60.8  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3006  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  30 
 
 
289 aa  60.8  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.265134  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0093  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  29.66 
 
 
192 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1310  hypothetical protein  40.54 
 
 
306 aa  59.3  0.00000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0968  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000162984  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0989  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.800938  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1134  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000000258795  hitchhiker  0.0000968229 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0913  hypothetical protein  27.01 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0877  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0935  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.8  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0968  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0905  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  58.5  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1258  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.96 
 
 
294 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.818065  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2272  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000409269  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00786  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01899  conserved protein with NAD(P)-binding Rossmann-fold domain  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0183339  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1666  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.33 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00191568  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2823  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0819  hypothetical protein  26.28 
 
 
253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2529  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.990181  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0664  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00803  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0656  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.28 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0968  hypothetical protein  38.67 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.495532  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0889  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.479275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0843  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4888  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  25.37 
 
 
217 aa  57.4  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.550857  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1662  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.84 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2289  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG like protein  37.84 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156844  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0825  hypothetical protein  26.28 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2602e-53 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2835  hypothetical protein  33.33 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000168176  normal  0.833391 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2113  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  3.00781e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0668  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  27.01 
 
 
253 aa  57.4  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.988638  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01888  hypothetical protein  33.33 
 
 
310 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.014746  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1586  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.84 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1638  hypothetical protein  33.33 
 
 
307 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.383508  hitchhiker  0.0042534 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0876  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2824  hypothetical protein  38.67 
 
 
306 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4524  hypothetical protein  28.46 
 
 
253 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0816159 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3251  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  32.5 
 
 
366 aa  56.6  0.0000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1027  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.5 
 
 
464 aa  56.2  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3315  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  26.63 
 
 
349 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.322288  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2911  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.78 
 
 
284 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.514235  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0320  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  37.5 
 
 
175 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.570438  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3357  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  24.54 
 
 
358 aa  55.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4931  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  29.23 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.143561 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1729  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.12 
 
 
205 aa  55.1  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.698671 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2124  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  26.15 
 
 
216 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.402934  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2556  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  30.91 
 
 
318 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000497106  hitchhiker  9.91148e-17 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2997  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  37.78 
 
 
282 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2287  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  31.78 
 
 
167 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000631193  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0152  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG  38.36 
 
 
172 aa  54.3  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.909719 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4184  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  28.93 
 
 
273 aa  54.3  0.000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.912644  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0806  hypothetical protein  28.1 
 
 
219 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0930  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  34.25 
 
 
357 aa  54.3  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4195  LysM domain-containing protein  35.14 
 
 
303 aa  53.5  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.543729  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1014  hypothetical protein  29.23 
 
 
190 aa  53.5  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00318676  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2350  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00214407  hitchhiker  0.00290758 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2191  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0598  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  36 
 
 
306 aa  53.9  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2184  hypothetical protein  33.77 
 
 
309 aa  53.5  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.295088  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0909  ErfK/YbiS/YcfS/YnhG family protein  33.68 
 
 
304 aa  53.5  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00324267  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>