17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4507 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_4507  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  224  3e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11440  hypothetical protein  43.75 
 
 
104 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2003  hypothetical protein  45.36 
 
 
104 aa  67  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00035748  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1453  hypothetical protein  42.31 
 
 
112 aa  61.6  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.297138  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3211  hypothetical protein  48.08 
 
 
99 aa  47  0.00009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.47234  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1972  hypothetical protein  44.23 
 
 
76 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192327  normal  0.0363609 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3151  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.213868  hitchhiker  0.0000000948825 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3095  hypothetical protein  46.15 
 
 
82 aa  44.7  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00697991  hitchhiker  0.00154018 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6514  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  43.9  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.146793  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1780  hypothetical protein  36.54 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2545  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0768609  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3159  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0975559  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3177  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0330701  hitchhiker  0.0000310225 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2014  hypothetical protein  38.64 
 
 
63 aa  41.6  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4912  hypothetical protein  37.74 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2286  hypothetical protein  40.38 
 
 
76 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0951  hypothetical protein  40.38 
 
 
64 aa  40.4  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.13257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>