27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1957 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1957  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  280  6.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127418  hitchhiker  0.00000331602 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3367  hypothetical protein  63.96 
 
 
133 aa  149  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00403112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1968  hypothetical protein  62.9 
 
 
125 aa  146  7e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1065  hypothetical protein  59.32 
 
 
130 aa  145  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.891186  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1590  hypothetical protein  58.68 
 
 
133 aa  134  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.500366  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0087  hypothetical protein  53.33 
 
 
125 aa  132  1.9999999999999998e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.193229 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5503  hypothetical protein  52.89 
 
 
132 aa  130  5e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.125578  normal  0.278605 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1550  hypothetical protein  49.18 
 
 
128 aa  118  3e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.3108  normal  0.341689 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3515  hypothetical protein  47.93 
 
 
124 aa  118  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6309  hypothetical protein  46.4 
 
 
127 aa  118  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.559851 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2150  hypothetical protein  40.65 
 
 
127 aa  115  3e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000252745  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2530  hypothetical protein  49.18 
 
 
136 aa  114  5e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3618  hypothetical protein  56.2 
 
 
130 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0549643  normal  0.133931 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2277  hypothetical protein  41.27 
 
 
127 aa  111  3e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00216052 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1723  hypothetical protein  53.23 
 
 
136 aa  111  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1794  hypothetical protein  53.23 
 
 
136 aa  110  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2347  hypothetical protein  47.97 
 
 
130 aa  110  9e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431986  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1121  hypothetical protein  49.17 
 
 
125 aa  109  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.705516  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2155  hypothetical protein  52.42 
 
 
136 aa  107  5e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1809  hypothetical protein  43.9 
 
 
150 aa  106  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0147  hypothetical protein  46.28 
 
 
128 aa  106  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.416427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3203  hypothetical protein  45.9 
 
 
142 aa  106  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00257301  normal  0.651911 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1634  hypothetical protein  46.77 
 
 
134 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2565  hypothetical protein  33.6 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2572  hypothetical protein  40.5 
 
 
130 aa  87  8e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.486576  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13590  hypothetical protein  40.5 
 
 
162 aa  80.1  0.000000000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.486672  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39738  predicted protein  38.54 
 
 
749 aa  48.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>