26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4514 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_4514  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  234  4e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5197  hypothetical protein  34.95 
 
 
129 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10372  hypothetical protein  33.96 
 
 
129 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.898247  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5915  hypothetical protein  34.62 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.352211 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2689  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2659  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2704  hypothetical protein  33.01 
 
 
130 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.725344  normal  0.0186033 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0527  hypothetical protein  37.5 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2370  hypothetical protein  36.54 
 
 
127 aa  44.3  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.233372  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1141  hypothetical protein  32.08 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0270  hypothetical protein  38.3 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4620  hypothetical protein  33.96 
 
 
74 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1398  hypothetical protein  33.93 
 
 
73 aa  42  0.003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.93105 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1576  hypothetical protein  38.33 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000119681  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3194  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0911957  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3573  hypothetical protein  42.86 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0281  hypothetical protein  36.67 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.804156  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1394  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2558  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1619  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2120  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2629  hypothetical protein  32.14 
 
 
74 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2645  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2505  hypothetical protein  37.25 
 
 
74 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.710828  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0222  hypothetical protein  30.77 
 
 
70 aa  40.8  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0222  hypothetical protein  29.23 
 
 
70 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>