22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3628 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2582  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000204702  hitchhiker  0.000111004 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3631  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00123736  normal  0.0173751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3630  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00148729  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3628    100 
 
 		 4277 bp  8479    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0797695  decreased coverage  0.00230701 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3600  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0391749  normal  0.108213 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3599  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0183066  normal  0.0904945 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3488  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000115095  normal  0.0186505 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3487  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000245666  normal  0.022754 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2583  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000066055  hitchhiker  0.000152881 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2560  Integrase catalytic region  100 
 
 		 924 bp  1832    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000211729  normal  0.0105372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2559  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000308015  hitchhiker  0.00371198 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2558    100 
 
 		 2803 bp  3092    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000161046  hitchhiker  0.00904245 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2049    97.1 
 
 		 2995 bp  2476    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0144762  decreased coverage  0.00465483 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2043    96.46 
 
 		 2389 bp  2405    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.153153  hitchhiker  0.00767267 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3713  Integrase catalytic region  100 
 
 		 894 bp  1772    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0391969  normal  0.214185 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3714  hypothetical protein  100 
 
 		 345 bp  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00862843  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3888    85.77 
 
 		 2845 bp  210  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0687901  normal  0.0695799 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1589    84.55 
 
 		 2527 bp  176  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.330656  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3424    86.23 
 
 		 2811 bp  123  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.212829  normal  0.19279 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1935  Histidine kinase  89.23 
 
 		 1095 bp  73.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3845  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  91.3 
 
 		 1179 bp  60  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.5258  normal  0.79155 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3381  histidine kinase  85.51 
 
 		 1302 bp  58  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>