22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3597 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3597  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  201  3e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0220403  normal  0.150744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0229  hypothetical protein  99.03 
 
 
103 aa  198  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00650925  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4937  hypothetical protein  46.32 
 
 
100 aa  84.7  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0942903  normal  0.32552 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2300  hypothetical protein  40.43 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1096  hypothetical protein  42.11 
 
 
100 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1746  hypothetical protein  43.16 
 
 
100 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0623584  normal  0.256502 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1052  hypothetical protein  48.89 
 
 
99 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00452566  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1179  hypothetical protein  52.63 
 
 
100 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.933496  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5651  hypothetical protein  51.58 
 
 
100 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1983  hypothetical protein  40 
 
 
100 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490297 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0965  hypothetical protein  50 
 
 
101 aa  68.2  0.00000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00474357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5400  hypothetical protein  38.54 
 
 
102 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4717  Antibiotic biosynthesis monooxygenase  39.18 
 
 
101 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.649718 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_4010  hypothetical protein  44.21 
 
 
239 aa  62.4  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.927237  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0915  hypothetical protein  44.21 
 
 
100 aa  61.2  0.000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4025  hypothetical protein  41.76 
 
 
99 aa  61.2  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.373255  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1383  hypothetical protein  31.58 
 
 
121 aa  56.6  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4409  hypothetical protein  36.46 
 
 
98 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.5782  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1939  hypothetical protein  33.68 
 
 
219 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1950  hypothetical protein  37.35 
 
 
219 aa  53.9  0.0000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2930  hypothetical protein  38.89 
 
 
102 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00884619  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2717  antibiotic biosynthesis monooxygenase  31.07 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00732478  normal  0.927978 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>