21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2994 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_2994  hypothetical protein  100 
 
 
236 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0023036  hitchhiker  0.000591455 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3341  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  40.65 
 
 
238 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000173938 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3113  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  41.39 
 
 
238 aa  125  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6046  hypothetical protein  34.67 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0936816  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2523  hypothetical protein  39.44 
 
 
242 aa  96.7  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.152944  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5484  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  37.95 
 
 
239 aa  94.4  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000353718  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20680  hypothetical protein  32.5 
 
 
258 aa  90.9  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0485442  normal  0.374209 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0056  hypothetical protein  39.5 
 
 
180 aa  82.4  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5617  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  32.14 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.308775  normal  0.170718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3655  hypothetical protein  31.71 
 
 
230 aa  76.3  0.0000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0168589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0024  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.48 
 
 
254 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4508  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  33.75 
 
 
284 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2050  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  29.46 
 
 
272 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.909792  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0168  hypothetical protein  30.24 
 
 
256 aa  58.9  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1505  hypothetical protein  29.95 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0282  hypothetical protein  33.56 
 
 
301 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1455  hypothetical protein  33.65 
 
 
219 aa  53.9  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0282  mycothiol-dependent maleylpyruvate isomerase  32.59 
 
 
281 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000278358 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1506  hypothetical protein  28.86 
 
 
253 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000182579 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0690  hypothetical protein  28.09 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.435926 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3634  hypothetical protein  30 
 
 
203 aa  42.4  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>