72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0773 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007798  NSE_0773  lysyl-tRNA synthetase  100 
 
 
505 aa  1039    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0860  lysyl-tRNA synthetase  55.71 
 
 
511 aa  591  1e-167  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0503  lysyl-tRNA synthetase  54.6 
 
 
550 aa  553  1e-156  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5166  lysyl-tRNA synthetase  52.94 
 
 
545 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1000  lysyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
545 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.771898  normal  0.632109 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0888  lysyl-tRNA synthetase  52.75 
 
 
545 aa  544  1e-153  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0730  lysyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 
546 aa  542  1e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.136179  normal  0.324611 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0413  lysyl-tRNA synthetase  52.73 
 
 
511 aa  536  1e-151  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.738039  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1065  lysyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 
567 aa  535  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.115893 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0626  lysyl-tRNA synthetase  53.25 
 
 
511 aa  534  1e-150  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0151  lysyl-tRNA synthetase  52.18 
 
 
543 aa  528  1e-148  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0201  lysyl-tRNA synthetase  51.8 
 
 
543 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0790  lysyl-tRNA synthetase  52.08 
 
 
548 aa  523  1e-147  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.677714  hitchhiker  0.00421967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2384  lysyl-tRNA synthetase  52.27 
 
 
565 aa  525  1e-147  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0707  lysyl-tRNA synthetase  52.62 
 
 
519 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.407177  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0432  lysyl-tRNA synthetase  53.03 
 
 
539 aa  519  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.316721  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3162  lysyl-tRNA synthetase  51.34 
 
 
567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.152215  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2980  lysyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
582 aa  511  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387429 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3206  lysyl-tRNA synthetase  50.38 
 
 
567 aa  512  1e-144  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6283  lysyl-tRNA synthetase  50.76 
 
 
567 aa  512  1e-144  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.375392 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1625  lysyl-tRNA synthetase  50.57 
 
 
568 aa  510  1e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.279844  normal  0.0697813 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7217  lysyl-tRNA synthetase  50.95 
 
 
567 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.273828  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3798  lysyl-tRNA synthetase  50.75 
 
 
585 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0017  lysyl-tRNA synthetase  51.82 
 
 
553 aa  506  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0137  lysyl-tRNA synthetase  51.3 
 
 
552 aa  501  1e-140  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0268  lysyl-tRNA synthetase  51.06 
 
 
540 aa  498  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0782951  normal  0.684652 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3566  lysyl-tRNA synthetase  50.78 
 
 
583 aa  492  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.279975  normal  0.84851 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0509  lysyl-tRNA synthetase  49.71 
 
 
529 aa  491  1e-137  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1321  lysyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
530 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1576  lysyl-tRNA synthetase  48.82 
 
 
530 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.286152  normal  0.0216142 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1360  lysyl-tRNA synthetase  49.05 
 
 
553 aa  480  1e-134  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0463  lysyl-tRNA synthetase  48.44 
 
 
533 aa  479  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0614307  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3971  lysyl-tRNA synthetase  49.81 
 
 
551 aa  481  1e-134  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2206  lysyl-tRNA synthetase  48.56 
 
 
552 aa  477  1e-133  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.485423  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2237  lysyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
526 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0487  lysyl-tRNA synthetase  48.13 
 
 
526 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.481224  normal  0.149534 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0584  lysyl-tRNA synthetase  48.63 
 
 
526 aa  476  1e-133  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.135058  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0790  lysyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
551 aa  471  1.0000000000000001e-131  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0741  lysyl-tRNA synthetase  49.04 
 
 
551 aa  470  1.0000000000000001e-131  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2261  lysyl-tRNA synthetase  46.15 
 
 
547 aa  469  1.0000000000000001e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3617  lysyl-tRNA synthetase  46.62 
 
 
548 aa  466  9.999999999999999e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.983213  normal  0.281407 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2360  lysyl-tRNA synthetase  45.9 
 
 
534 aa  437  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0578  lysyl-tRNA synthetase  31.62 
 
 
529 aa  241  2.9999999999999997e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2340  lysine--tRNA ligase, class I (lysyl-tRNA synthetase, class I)  28.46 
 
 
517 aa  162  9e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2651  lysyl-tRNA synthetase  28 
 
 
517 aa  162  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0307953  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2567  lysyl-tRNA synthetase  28.73 
 
 
517 aa  161  3e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2757  lysyl-tRNA synthetase  28.63 
 
 
517 aa  160  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000778634 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2375  lysine--tRNA ligase (lysyl-tRNA synthetase)  28.54 
 
 
517 aa  156  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2815  lysyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
533 aa  155  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000378185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2387  lysyl-tRNA synthetase  28.28 
 
 
567 aa  146  1e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.353183  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0116  lysyl-tRNA synthetase  26.71 
 
 
505 aa  146  1e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1974  lysyl-tRNA synthetase  29.26 
 
 
546 aa  145  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.608972  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2180  lysyl-tRNA synthetase  26.46 
 
 
492 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.02262  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1509  lysyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 
568 aa  134  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0275  lysyl-tRNA synthetase  26.89 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0922  lysyl-tRNA synthetase  25.74 
 
 
524 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1355  lysyl-tRNA synthetase  28.11 
 
 
533 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3478  lysyl-tRNA synthetase  25.59 
 
 
553 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0679  lysyl-tRNA synthetase  25.3 
 
 
521 aa  131  3e-29  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2553  lysyl-tRNA synthetase  25.24 
 
 
528 aa  130  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.584812  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0629  lysyl-tRNA synthetase  27.41 
 
 
533 aa  128  3e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0563  lysyl-tRNA synthetase  26.6 
 
 
533 aa  127  5e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.318054  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1507  lysyl-tRNA synthetase  25.93 
 
 
537 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1293  lysyl-tRNA synthetase  29.22 
 
 
600 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1865  lysyl-tRNA synthetase  26.98 
 
 
528 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0773  lysyl-tRNA synthetase  27.31 
 
 
497 aa  116  7.999999999999999e-25  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0215  lysyl-tRNA synthetase  26.81 
 
 
545 aa  109  1e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.273119  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4154  lysyl-tRNA synthetase  23.61 
 
 
527 aa  108  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0786  lysyl-tRNA synthetase  24.07 
 
 
537 aa  100  7e-20  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.930737  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1618  lysine--tRNA ligase  23.72 
 
 
641 aa  90.1  8e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0571  lysyl-tRNA synthetase  23.58 
 
 
598 aa  78.6  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.26496  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1670  cysteinyl-tRNA synthetase  26.7 
 
 
457 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>