18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1612 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1612  V-type ATP synthase subunit E  100 
 
 		 182 aa  360  5.0000000000000005e-99  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.923493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1240  V-type ATP synthase subunit E  38.25 
 
 		 183 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0389  V-type ATP synthase subunit E  35.52 
 
 		 183 aa  125  3e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0284  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  35.08 
 
 		 192 aa  105  3e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1434  V-type ATP synthase subunit E  32.8 
 
 		 207 aa  104  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2680  H+transporting two-sector ATPase E subunit  30.37 
 
 		 191 aa  94.4  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0166336  normal  0.115798 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1219  hypothetical protein  33.33 
 
 		 192 aa  91.7  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000580099  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1374  H+transporting two-sector ATPase E subunit  33.51 
 
 		 193 aa  83.6  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0278  V-type ATP synthase subunit E  30 
 
 		 192 aa  82.8  0.000000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.591531 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3350  H+transporting two-sector ATPase E subunit  34.55 
 
 		 193 aa  80.1  0.00000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1180  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  25.65 
 
 		 191 aa  75.9  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0119921  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2348  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  28.8 
 
 		 191 aa  67.4  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.23341 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1278  V-type ATP synthase subunit E  27.75 
 
 		 194 aa  64.3  0.0000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1692  H+transporting two-sector ATPase E subunit  25.6 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.671427 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0706  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  34.94 
 
 		 190 aa  48.5  0.00005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0351771 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1960  H+transporting two-sector ATPase E subunit  37.5 
 
 		 190 aa  47.8  0.00009  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73432  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2318  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  34.72 
 
 		 188 aa  45.4  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.369996  hitchhiker  0.000392514 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2088  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  38.89 
 
 		 190 aa  44.7  0.0008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>