18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0284 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0284  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  100 
 
 		 192 aa  386  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.591036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2680  H+transporting two-sector ATPase E subunit  54.97 
 
 		 191 aa  207  7e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0166336  normal  0.115798 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1180  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  51.83 
 
 		 191 aa  201  6e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0119921  normal  0.549176 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2348  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  53.93 
 
 		 191 aa  193  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.23341 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1219  hypothetical protein  47.64 
 
 		 192 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000000580099  normal  0.235288 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1612  V-type ATP synthase subunit E  35.08 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.923493  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1240  V-type ATP synthase subunit E  34.55 
 
 		 183 aa  102  2e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0389  V-type ATP synthase subunit E  30.37 
 
 		 183 aa  89.7  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0278  V-type ATP synthase subunit E  27.18 
 
 		 192 aa  74.3  0.0000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.591531 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1374  H+transporting two-sector ATPase E subunit  29.9 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3350  H+transporting two-sector ATPase E subunit  31.44 
 
 		 193 aa  73.9  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1434  V-type ATP synthase subunit E  27.98 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1278  V-type ATP synthase subunit E  30.41 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1773  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  25.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1916  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  26.63 
 
 		 192 aa  47.4  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000000777149  normal  0.663872 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0706  H+-transporting two-sector ATPase, E subunit  26.11 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0351771 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1629  H+transporting two-sector ATPase E subunit  24.6 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.10454  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1960  H+transporting two-sector ATPase E subunit  36.25 
 
 		 190 aa  42  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.73432  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>