28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1157 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1157  integral membrane protein  100 
 
 		 214 aa  424  1e-118  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0042  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.97 
 
 		 206 aa  162  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.122613  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0801  integral membrane protein  40.53 
 
 		 207 aa  148  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2258  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.11 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00000178215  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0776  biopolymer transport protein-like protein  34.8 
 
 		 198 aa  122  4e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0180  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.55 
 
 		 213 aa  122  5e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.239441  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1234  MotA/TolQ/ExbB proton channel  33 
 
 		 197 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3673  biopolymer transport protein-like protein  33.65 
 
 		 198 aa  112  5e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1080  integral membrane protein  33.01 
 
 		 199 aa  109  2.0000000000000002e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00417975  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1200  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.71 
 
 		 213 aa  105  6e-22  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.255062  normal  0.76631 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0754  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.73 
 
 		 213 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1479  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.72 
 
 		 213 aa  103  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0723  hypothetical protein  33.68 
 
 		 226 aa  97.8  1e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4504  hypothetical protein  48 
 
 		 233 aa  94.7  9e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.4366  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1640  MotA/TolQ/ExbB proton channel  32.82 
 
 		 231 aa  94.4  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.494463  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1555  hypothetical protein  36.6 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1725  hypothetical protein  50 
 
 		 234 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.142082  normal  0.485434 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1965  hypothetical protein  31.07 
 
 		 212 aa  89.7  3e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2338  MotA/TolQ/ExbB proton channel  28.87 
 
 		 204 aa  82.8  0.000000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39630  hypothetical protein  44.83 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.854792 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2653  hypothetical protein  42.53 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3362  hypothetical protein  42.53 
 
 		 158 aa  82  0.000000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00286668  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3487  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.57 
 
 		 217 aa  79  0.00000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2684  hypothetical protein  29.47 
 
 		 181 aa  75.5  0.0000000000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.288279  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0793  hypothetical protein  49.21 
 
 		 147 aa  70.9  0.00000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.716115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27470  hypothetical protein  45.71 
 
 		 150 aa  67  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0203216  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0117  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.18 
 
 		 145 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  24.37 
 
 		 235 aa  41.6  0.009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>