14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1138 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_1138  zinc finger protein  100 
 
 
69 aa  142  1e-33  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0148  zinc finger protein  69.57 
 
 
71 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1693  zinc finger protein  69.57 
 
 
71 aa  110  5e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0785  zinc finger protein  69.57 
 
 
71 aa  110  6e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.282541  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0207  zinc finger protein  68.12 
 
 
71 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.423209  normal  0.336406 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0240  zinc finger protein  63.77 
 
 
69 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.665758  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0852  hypothetical protein  64.71 
 
 
69 aa  101  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1928  hypothetical protein  64.71 
 
 
69 aa  101  3e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1285  hypothetical protein  55.22 
 
 
70 aa  89.4  2e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.378904 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2452  hypothetical protein  50.72 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0945683  normal  0.421452 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2453  zinc finger protein  50 
 
 
73 aa  67.8  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.054676  normal  0.411172 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2373  hypothetical protein  43.66 
 
 
78 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2374  hypothetical protein  40.62 
 
 
75 aa  55.1  0.0000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3681  hypothetical protein  39.39 
 
 
69 aa  45.1  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.206918  normal  0.10285 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>