18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0222 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0222  hypothetical protein  100 
 
 
161 aa  318  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.495802  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  35.14 
 
 
177 aa  45.1  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  26.32 
 
 
152 aa  44.7  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  31.4 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  31.4 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  31.4 
 
 
167 aa  43.9  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  36.49 
 
 
144 aa  44.3  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.67 
 
 
274 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.8 
 
 
177 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1971  hypothetical protein  32.47 
 
 
127 aa  43.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  32.89 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  34.25 
 
 
150 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  32.88 
 
 
151 aa  42.4  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  32.89 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  32.89 
 
 
142 aa  42.4  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0473  hypothetical protein  30.88 
 
 
105 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0174667 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  25.19 
 
 
152 aa  40.8  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  26.05 
 
 
157 aa  40.8  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>