46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1136 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1136  protein of unknown function DUF526  100 
 
 		 88 aa  167  3e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059241 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3536  hypothetical protein  60.76 
 
 		 91 aa  100  8e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.764838  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3020  protein of unknown function DUF526  60.26 
 
 		 86 aa  92.8  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2251  hypothetical protein  58.82 
 
 		 96 aa  92.8  1e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.801472  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2757  protein of unknown function DUF526  59.49 
 
 		 86 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1640  hypothetical protein  61.04 
 
 		 106 aa  91.7  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1476  hypothetical protein  58.44 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0240368  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1526  hypothetical protein  58.44 
 
 		 106 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4162  hypothetical protein  56.41 
 
 		 92 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.186646 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1766  hypothetical protein  59.21 
 
 		 96 aa  88.2  4e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1581  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00359975  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0233  hypothetical protein  57.69 
 
 		 82 aa  85.1  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2505  hypothetical protein  56.58 
 
 		 85 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.460066 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1375  protein of unknown function DUF526  53.25 
 
 		 96 aa  83.6  8e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.308026  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0261  hypothetical protein  57.33 
 
 		 82 aa  83.6  8e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.783765 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3873  hypothetical protein  53.95 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0389052  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3096  hypothetical protein  55.13 
 
 		 85 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3332  hypothetical protein  56 
 
 		 79 aa  81.3  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.296234  normal  0.385711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2263  hypothetical protein  54.67 
 
 		 109 aa  81.3  0.000000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.904294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1414  hypothetical protein  50.62 
 
 		 88 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0680005  normal  0.577769 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4948  hypothetical protein  50.67 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.889907  hitchhiker  0.000000138953 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2214  hypothetical protein  55.56 
 
 		 84 aa  79.3  0.00000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.309689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3170  hypothetical protein  53.33 
 
 		 91 aa  79  0.00000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.142046  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4065  protein of unknown function DUF526  46.91 
 
 		 93 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.955686 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2648  hypothetical protein  54.67 
 
 		 80 aa  79  0.00000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.250231  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4026  protein of unknown function DUF526  48.68 
 
 		 93 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.180444  normal  0.460906 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3771  hypothetical protein  46.91 
 
 		 93 aa  78.2  0.00000000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.208302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0621  hypothetical protein  53.42 
 
 		 87 aa  77.4  0.00000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4841  protein of unknown function DUF526  51.28 
 
 		 92 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.546287  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0853  hypothetical protein  46.05 
 
 		 107 aa  74.7  0.0000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2149  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0993  hypothetical protein  45 
 
 		 88 aa  72.8  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0435364  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2547  hypothetical protein  57.89 
 
 		 108 aa  68.2  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1095  protein of unknown function DUF526  41.33 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.181448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4470  hypothetical protein  49.32 
 
 		 86 aa  55.5  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.633615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0762  hypothetical protein  41.1 
 
 		 107 aa  50.8  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.468252 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3279  hypothetical protein  44.16 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3099  hypothetical protein  40.23 
 
 		 95 aa  48.9  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2667  hypothetical protein  43.9 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.149229  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0040  hypothetical protein  50.67 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.180106  normal  0.479768 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0427  hypothetical protein  43.84 
 
 		 117 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00075  hypothetical protein  34.12 
 
 		 83 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0238  hypothetical protein  30.59 
 
 		 85 aa  42.4  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2004  hypothetical protein  31.71 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2138  hypothetical protein  35.8 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0196  protein of unknown function DUF526  31.76 
 
 		 85 aa  41.2  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.969405  normal  0.608689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>