11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1109 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1514  transposase, IS605 OrfB family  81.66 
 
 		 1215 bp  648    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2717  transposase, IS605 OrfB family  81.66 
 
 		 1215 bp  648    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.119392  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1109    100 
 
 		 2611 bp  5176    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.624719  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1110  IS605 family transposase OrfB  100 
 
 		 1224 bp  2426    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.48551  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1111  DNA binding domain-containing protein  100 
 
 		 648 bp  1285    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.385151  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2771  transposase, IS605 OrfB family  84.51 
 
 		 1221 bp  464  9.999999999999999e-129  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.680266  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1513  DNA binding domain protein, excisionase family  82.86 
 
 		 642 bp  396  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2716  DNA binding domain protein, excisionase family  82.86 
 
 		 642 bp  396  1e-107  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00788025  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2733    84.59 
 
 		 1824 bp  242  4e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0834524  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2769    86.08 
 
 		 1850 bp  240  2.0000000000000002e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.543689  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2732    88.68 
 
 		 261 bp  115  7.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  decreased coverage  0.00753922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>