19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1074 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1074  carotene hydroxylase  100 
 
 		 157 aa  315  1e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0702  fatty acid hydroxylase  66.21 
 
 		 151 aa  215  2e-55  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2038  beta-carotene hydroxylase  40.71 
 
 		 155 aa  104  6e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0223903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4535  carotene hydroxylase  41.83 
 
 		 168 aa  103  1e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1710  fatty acid hydroxylase  39.44 
 
 		 157 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0174617  normal  0.199306 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5702  fatty acid hydroxylase  40.14 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.733403 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5618  fatty acid hydroxylase  41.27 
 
 		 158 aa  89.4  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2128  carotene hydroxylase  35.67 
 
 		 200 aa  87.8  5e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.287054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0059  carotene hydroxylase  37.5 
 
 		 146 aa  86.3  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2033  fatty acid hydroxylase  42.37 
 
 		 158 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2089  fatty acid hydroxylase  42.22 
 
 		 152 aa  84.7  5e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.213926  normal  0.0390398 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1168  carotene hydroxylase  37.14 
 
 		 176 aa  84  7e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0482  fatty acid hydroxylase  41.67 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00925  beta carotene hydroxylase  38.58 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0820684  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2665  fatty acid hydroxylase  31.17 
 
 		 155 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_9013  predicted protein  32.67 
 
 		 153 aa  63.2  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0252602  normal  0.0220603 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2647  fatty acid hydroxylase  27.74 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.810487  normal  0.467325 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2516  carotene hydroxylase  26.8 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3246  beta-carotene hydroxylase  26.14 
 
 		 155 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>