18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0680 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0680  hypothetical protein  100 
 
 		 533 aa  1076    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000787674  hitchhiker  0.00000670884 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0167  Protein of unknown function DUF2070, membrane  38.36 
 
 		 538 aa  377  1e-103  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0544  membrane protein-like  24.25 
 
 		 544 aa  78.6  0.0000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0620  membrane protein-like protein  25.37 
 
 		 581 aa  72.4  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0934  FAD dependent oxidoreductase  24.09 
 
 		 576 aa  68.9  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0753636 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0860  hypothetical protein  24.37 
 
 		 579 aa  67.8  0.0000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.781635  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1087  hypothetical protein  25 
 
 		 578 aa  62  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0113336  normal  0.187801 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0076  hypothetical protein  21.35 
 
 		 580 aa  60.1  0.00000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0190792  normal  0.314766 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1444  Protein of unknown function DUF2070, membrane  21.66 
 
 		 566 aa  57  0.0000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0030  hypothetical protein  21.49 
 
 		 619 aa  55.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00669856  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2422  hypothetical protein  23.04 
 
 		 618 aa  53.9  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.396799  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2078  hypothetical protein  22.87 
 
 		 535 aa  53.5  0.000008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0196  hypothetical protein  20.53 
 
 		 583 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.814189  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1657  hypothetical protein  22.27 
 
 		 578 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0652307 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0716  hypothetical protein  23.93 
 
 		 536 aa  50.1  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.403776 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2307  hypothetical protein  23.6 
 
 		 536 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00335528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1950  hypothetical protein  24.12 
 
 		 536 aa  45.4  0.003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0450  membrane protein-like protein  19.61 
 
 		 589 aa  43.9  0.007  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.336439  normal  0.520524 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>