35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_3017 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_3017  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  340  7e-93  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000243008  normal  0.0643153 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1232  hypothetical protein  61.87 
 
 		 176 aa  197  5e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.0000655533  normal  0.647913 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1360  hypothetical protein  32.95 
 
 		 203 aa  107  9.000000000000001e-23  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0205277 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0876  hypothetical protein  30.64 
 
 		 330 aa  80.9  0.000000000000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.423577  normal  0.480034 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1575  hypothetical protein  34.96 
 
 		 240 aa  74.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4736  hypothetical protein  36.61 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.196854  normal  0.935032 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2483  hypothetical protein  42.2 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.292542  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1118  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1598  hypothetical protein  33.33 
 
 		 239 aa  71.2  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2602  hypothetical protein  29.52 
 
 		 183 aa  70.5  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.524516  normal  0.221337 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1770  putative transmembrane protein  42.16 
 
 		 220 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2473  putative transmembrane protein  39.09 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578174  normal  0.940793 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1494  hypothetical protein  36.61 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1639  hypothetical protein  36.19 
 
 		 227 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00765  hypothetical protein  28.81 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.547305  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1214  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0931852  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0803  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0358  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.240886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1701  hypothetical protein  40.45 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.836141  n/a   
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4922  hypothetical protein  29.14 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.131667  normal  0.987172 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1514  hypothetical protein  37.63 
 
 		 236 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.875817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1601  hypothetical protein  30.43 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1842  hypothetical protein  41.94 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1857  hypothetical protein  41.94 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.704387  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2011  hypothetical protein  41.94 
 
 		 244 aa  64.3  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1945  hypothetical protein  33.33 
 
 		 177 aa  62  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.88314  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1632  putative transmembrane protein  35.71 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.449297 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5458  hypothetical protein  32.97 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0220  hypothetical protein  29.11 
 
 		 197 aa  52.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.231447 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0124  hypothetical protein  25.73 
 
 		 204 aa  51.2  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08311  hypothetical protein  24.75 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000165507 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5516  hypothetical protein  29.76 
 
 		 202 aa  48.9  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.317091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2187  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5890  hypothetical protein  27 
 
 		 206 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4736  hypothetical protein  32 
 
 		 206 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  hitchhiker  0.00217507  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>